Het gebruik van chemische pesticiden moet worden verminderd, waardoor microbiële biologische bestrijders(MBCA) steeds meer aandacht krijgen. Screeningsmethoden voor MBCAs zijn sterk gericht op productie van uitgescheiden metabolieten waardoor MBCA's met nieuwe werkingsmechanismen niet worden opgepikt. Dit project heeft tot doel nieuwe biocontrolemechanismen tegen bodempathogenen te bestuderen in vijf taxonomische verwante plant-geassocieerde Pseudomonas-stammen afkomstig uit ziekteonderdrukkende bodems of rijstplanten met verschillende in vitro en in planta activiteit tegen fytopathogenen. Drie stammen, die gelijkaardige antifungale cyclische lipopeptiden (CLP's) produceren, vertonen in vitro een sterk antagonisme tegen de schimmel Rhizoctonia solani, maar slechts één van de drie is effectief in een boon/R. solani pathosysteem. Eén stam (COR33) is in vitro inactief, maar zeer performant in planta, terwijl het vijfde isolaat (COR58) met sterke in planta activiteit, in vitro alleen actief is bij direct contact met de pathogeen. Genoomonderzoek toont aan dat COR33 een type 3-secretiesysteem (T3SS) aanmaakt dat kan interferen met de immuniteit van planten. COR58 heeft twee type 6-secretiesystemen (T6SS's) die mogelijk toxines direct in de pathogeen injecteren. De rol van CLPs, T3SS en T6SS in biocontrole wordt onderzocht in een multidisciplinaire benadering die genoomonderzoek, mutantconstructie, reporterstammen, (bio)chemische analyse, microscopie en biotoetsen omvat.