De belangrijkste expertise van deze onderzoeksgroep betreft de studie van de interacties van bacteriën en fungi die belangrijk zijn vanuit een diergeneeskundig of zoönotisch perspectief met hun gastheren en de omgeving. Ook optimalisatie van de diagnose van infecties met deze agentia, antibioticaresistentie en taxonomie behoren tot het onderzoeksdomein. De taxonomische studies worden vooral gebruikt als hulpmiddel in het onderzoek naar de interacties van bacteriën en fungi met hun gastheren en de omgeving.