Instellingen beheren
MENU
Over deze site
In English
Home
Onderzoekers
Projecten
Organisaties
Publicaties
Infrastructuur
Contact
Research Explorer
Uw browser ondersteunt geen JavaScript of JavaScript is niet ingeschakeld. Zonder JavaScript kan sommige functionaliteit van deze webapplicatie uitgeschakeld zijn of foutmeldingen veroorzaken. Raadpleeg om JavaScript in te schakelen de handleiding van uw browser of contacteer uw systeembeheerder.
Onderzoeker
Stephane Rombauts
Profiel
Projecten
Publicaties
Activiteiten
Prijzen & Erkenningen
111
Resultaten
2025
Cryo-EM structure of the brine shrimp mitochondrial ATP synthase suggests an inactivation mechanism for the ATP synthase leak channel
Amrendra Kumar
Juliana da Fonseca Rezende e Mello
Yangyu Wu
Daniel Morris
Ikram Mezghani
Erin Smith
Stephane Rombauts
Peter Bossier
Juno Krahn
Fred J. Sigworth
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
CELL DEATH AND DIFFERENTIATION
2025
2024
Scywalker : scalable end-to-end data analysis workflow for long-read single-cell transcriptome sequencing
Peter De Rijk
Tijs Watzeels
Fahri Küçükali
Jasper Van Dongen
Júlia Faura
Patrick Willems
Lara De Deyn
Lena Duchateau
Carolin Seyfferth
Thomas Eekhout
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
BIOINFORMATICS
2024
Seagrass genomes reveal ancient polyploidy and adaptations to the marine environment
Xiao Ma
Steffen Vanneste
Jiyang Chang
Luca Ambrosino
Kerrie Barry
Till Bayer
Alexander A. Bobrov
LoriBeth Boston
Justin E. Campbell
Hengchi Chen
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NATURE PLANTS
2024
The genome and population genomics of allopolyploid Coffea arabica reveal the diversification history of modern coffee cultivars
Jarkko Salojärvi
Aditi Rambani
Zhe Yu
Romain Guyot
Susan Strickler
Maud Lepelley
Cui Wang
Sitaram Rajaraman
Pasi Rastas
Chunfang Zheng
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NATURE GENETICS
2024
The genome‐wide response of Dermatophagoides pteronyssinus to cystatin A, a peptidase inhibitor from human skin, sheds light on its digestive physiology and allergenicity
José Cristian Vidal‐Quist
Félix Ortego
Stephane Rombauts
Pedro Hernández‐Crespo
A1
Artikel in een tijdschrift
in
INSECT MOLECULAR BIOLOGY
2024
2023
Identification and characterization of CYP71 subclade cytochrome P450 enzymes involved in the biosynthesis of bitterness compounds in Cichorium intybus
Charlotte De Bruyn
Tom Ruttink
Elia Lacchini
Stephane Rombauts
Annelies Haegeman
ellen de keyser
Christof Van Poucke
Sandrien Desmet
Thomas B. Jacobs
Tom Eeckhaut
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
FRONTIERS IN PLANT SCIENCE
2023
Industrial chicory genome gives insights into the molecular timetable of anther development and male sterility
Evelien Waegneer
Stephane Rombauts
Joost Baert
Nicolas Dauchot
Annick De Keyser
Tom Eeckhaut
Annelies Haegeman
Chang Liu
Olivier Maudoux
Christine Notté
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
FRONTIERS IN PLANT SCIENCE
2023
RNA viruses alter house dust mite physiology and allergen production with no detected consequences for allergenicity
José Cristian Vidal‐Quist
Jozefien Declercq
Stijn Vanhee
Bart Lambrecht
José Gómez‐Rial
Carmen Vidal
Eylem Aydogdu Lohaus
Stephane Rombauts
Pedro Hernández‐Crespo
A1
Artikel in een tijdschrift
in
INSECT MOLECULAR BIOLOGY
2023
Suppression of the Arabidopsis cinnamoyl-CoA reductase 1-6 intronic T-DNA mutation by epigenetic modification
Marlies Wouters
Héloïse Bastiaanse
Stephane Rombauts
Lisanne de Vries
Tim De Pooter
Mojca Strazisar
Godfrey Neutelings
Ruben Vanholme
Wout Boerjan
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT PHYSIOLOGY
2023
The genome and population genomics of allopolyploid Coffea arabica reveal the diversification history of modern coffee cultivars
Jarkko Salojärvi
Aditi Rambani
Zhe Yu
Romain Guyot
Susan Strickler
Maud Lepelley
Cui Wang
Sitaram Rajaraman
Pasi Rastas
Chunfang Zheng
et al.
Preprint
2023
2022
'Nebbiolo' genome assembly allows surveying the occurrence and functional implications of genomic structural variations in grapevines (Vitis vinifera L.).
Simone Maestri
Giorgio Gambino
Giulia Lopatriello
Andrea Minio
Irene Perrone
Emanuela Cosentino
Barbara Giovannone
Luca Marcolungo
Massimiliano Alfano
Stephane Rombauts
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
BMC GENOMICS
2022
Flemish soils contain rhizobia partners for Northwestern Europe‐adapted soybean cultivars
Judith Van Dingenen
Sonia García Méndez
Stien Beirinckx
Lena Vlaminck
Annick De Keyser
Naomi Stuer
Severine Verschaete
Alexander Clarysse
Joke Pannecoucque
Stephane Rombauts
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY
2022
Genomic evidence that a sexually selected trait captures genome-wide variation and facilitates the purging of genetic load
Jonathan M. Parrett
Sebastian Chmielewski
Eylem Aydogdu Lohaus
Aleksandra Łukasiewicz
Stephane Rombauts
Agnieszka Szubert-Kruszyńska
Wiesław Babik
Mateusz Konczal
Jacek Radwan
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NATURE ECOLOGY & EVOLUTION
2022
The genome of Corydalis reveals the evolution of benzylisoquinoline alkaloid biosynthesis in Ranunculales
Zhichao Xu
Zhen Li
Fengming Ren
Ranran Gao
Zhe Wang
Jinlan Zhang
Tao Zhao
Xiao Ma
Xiangdong Pu
Tianyi Xin
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT JOURNAL
2022
2021
De novo whole-genome assembly and discovery of genes involved in triterpenoid saponin biosynthesis of Vietnamese ginseng (Panax vietnamensis Ha et Grushv.)
Nguyen Quang Duc Tien
Xiao Ma
Le Quang Man
Duong Thi Kim Chi
Nguyen Xuan Huy
Duong-Tan Nhut
Stephane Rombauts
Tran Ut
Nguyen Hoang Loc
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PHYSIOLOGY AND MOLECULAR BIOLOGY OF PLANTS
2021
RNA viruses in the house dust mite Dermatophagoides pteronyssinus, detection in environmental samples and in commercial allergen extracts used for in vivo diagnosis
Jose Cristian Vidal-Quist
Carmen Vidal
Fernando Escolar
Bart Lambrecht
Stephane Rombauts
Pedro Hernandez-Crespo
A1
Artikel in een tijdschrift
in
ALLERGY
2021
Rapid protein evolution, organellar reductions, and invasive intronic elements in the marine aerobic parasite dinoflagellate Amoebophrya spp
Sarah Farhat
Phuong LE
Ehsan Kayal
Benjamin Noel
Estelle Bigeard
Erwan Corre
Florian Maumus
Isabelle Florent
Adriana Alberti
Jean-Marc Aury
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
BMC BIOLOGY
2021
The absence of the caffeine synthase gene is involved in the naturally decaffeinated status of Coffea humblotiana, a wild species from Comoro archipelago
Nathalie Raharimalala
Stephane Rombauts
Andrew McCarthy
Andréa Garavito
Simon Orozco-Arias
Laurence Bellanger
Alexa Yadira Morales-Correa
Solène Froger
Stéphane Michaux
Victoria Berry
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
SCIENTIFIC REPORTS
2021
The genome of the extremophile Artemia provides insight into strategies to cope with extreme environments
Stephanie De Vos
Stephane Rombauts
Louis Coussement
Wannes Dermauw
Marnik Vuylsteke
Patrick Sorgeloos
James S. Clegg
Ziro Nambu
Filip Van Nieuwerburgh
Parisa Norouzitallab
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
BMC GENOMICS
2021
Transcriptomic analysis of the poultry red mite, Dermanyssus gallinae, across all stages of the lifecycle
Kathryn Bartley
Wan Chen
Richard I. Lloyd Mills
Francesca Nunn
Daniel R. G. Price
Stephane Rombauts
Yves Van de Peer
Lise Roy
Alasdair J. Nisbet
Stewart T. G. Burgess
A1
Artikel in een tijdschrift
in
BMC GENOMICS
2021
2020
Genome streamlining in a minute herbivore that manipulates its host plant
Robert Greenhalgh
Wannes Dermauw
Joris J. Glas
Stephane Rombauts
Nicky Wybouw
Jainy Thomas
Juan M. Alba
Ellen J. Pritham
Saioa Legarrea
René Feyereisen
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
ELIFE
2020
Virus-host coexistence in phytoplankton through the genomic lens
Sheree Yau
Marc Krasovec
L. Felipe Benites
Stephane Rombauts
Mathieu Groussin
Emmelien Vancaester
Jean-Marc Aury
Evelyne Derelle
Yves Desdevises
Marie-Line Escande
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
SCIENCE ADVANCES
2020
2019
A genomic analysis and transcriptomic atlas of gene expression in Psoroptes ovis reveals feeding- and stage-specific patterns of allergen expression
Stewart TG Burgess
Edward J Marr
Kathryn Bartley
Francesca G Nunn
Rachel E Down
Robert J Weaver
Jessica C Prickett
Jackie Dunn
Stephane Rombauts
Thomas Van Leeuwen
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
BMC GENOMICS
2019
A genomic analysis and transcriptomic atlas of gene expression in Psoroptes ovis reveals feeding- and stage-specific patterns of allergen expression
Stewart TG Burgess
Edward J Marr
Kathryn Bartley
Francesca G Nunn
Rachel E Down
Robert J Weaver
Jessica C Prickett
Jackie Dunn
Stephane Rombauts
Thomas Van Leeuwen
et al.
Preprint
2019
Draft genome assembly of the false spider mite Brevipalpus yothersi
Denise Navia
Valdenice M. Novelli
Stephane Rombauts
Juliana Freitas-Astua
Renata Santos de Mendonca
Maria Andreia Nunes
Marcos A. Machado
Yao-Cheng Lin
Phuong LE
Zaichao Zhang
et al.
A2
Artikel in een tijdschrift
in
MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS
2019
Identification of salt stress response genes using the Artemia transcriptome
Stephanie De Vos
Gilbert Van Stappen
Patrick Sorgeloos
Marnik Vuylsteke
Stephane Rombauts
Peter Bossier
A1
Artikel in een tijdschrift
in
AQUACULTURE
2019
Pseudo-chromosome-length genome assembly of a double haploid 'Bartlett' pear (Pyrus communis L.)
Gareth Linsmith
Stephane Rombauts
Sara Montanari
Cecilia H Deng
Jean-Marc Celton
Philippe Guérif
Chang Liu
Rolf Lohaus
Jason D Zurn
Alessandro Cestaro
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
GIGASCIENCE
2019
2018
Draft genome assembly of the poultry red mite, Dermanyssus gallinae
Stewart TG Burgess
Kathryn Bartley
Francesca Nunn
Harry W Wright
Margaret Hughes
Matthew Gemmell
Sam Haldenby
Steve Paterson
Stephane Rombauts
Fiona M Tomley
et al.
A2
Artikel in een tijdschrift
in
MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS
2018
Draft genome assembly of the sheep scab mite, Psoroptes ovis
Stewart TG Burgess
Kathryn Bartley
Edward J Marr
Harry W Wright
Robert J Weaver
Jessica C Prickett
Margaret Hughes
Sam Haldenby
Phuong LE
Stephane Rombauts
et al.
A2
Artikel in een tijdschrift
in
GENOME ANNOUNCEMENTS
2018
Genome analyses of the microalga Picochlorum provide insights into the evolution of thermotolerance in the green lineage
Marc Krasovec
Emmelien Vancaester
Stephane Rombauts
François Bucchini
Sheree Yau
Claire Hemon
Hugo Lebredonchel
Nigel Grimsley
Herve Moreau
Sophie Sanchez-Brosseau
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
GENOME BIOLOGY AND EVOLUTION
2018
The 'TranSeq' 3'-end sequencing method for high-throughput transcriptomics and gene space refinement in plant genomes
Oren Tzfadia
Samuel Bocobza
Jonas Defoort
Efrat Almekias-Siegl
Sayantan Panda
Matan Levy
Veronique Storme
Stephane Rombauts
Diego Adhemar Jaitin
Hadas Keren-Shaul
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT JOURNAL
2018
The Chara genome : secondary complexity and implications for plant terrestrialization
Tomoaki Nishiyama
Hidetoshi Sakayama
Jan de Vries
Henrik Buschmann
Denis Saint-Marcoux
Kristian K Ullrich
Fabian B Haas
Lisa Vanderstraeten
Dirk Becker
Daniel Lang
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
CELL
2018
2017
A new version of the grapevine reference genome assembly (12X.v2) and of its annotation (VCost.v3)
A Canaguier
J Grimplet
G Di Gaspero
S Scalabrin
E Duchêne
N Choisne
N Mohellibi
C Guichard
Stephane Rombauts
I Le Clainche
et al.
A2
Artikel in een tijdschrift
in
GENOMICS DATA
2017
Dietary shifts have consequences for the repertoire of allergens produced by the European house dust mite
JC Vidal-Quist
F Ortego
Stephane Rombauts
P Castanera
P Hernandez-Crespo
A1
Artikel in een tijdschrift
in
MEDICAL AND VETERINARY ENTOMOLOGY
2017
Draft genome sequences of two unclassified Chitinophagaceae bacteria, IBVUCB1 and IBVUCB2, isolated from environmental samples
Russell JS Orr
Stephane Rombauts
Yves Van de Peer
Kamran Shalchian-Tabrizi
A2
Artikel in een tijdschrift
in
GENOME ANNOUNCEMENTS
2017
Draft genome sequences of two unclassified bacteria, Hydrogenophaga sp. strains IBVHS1 and IBVHS2, isolated from environmental samples
Russel J. S. Orr
Stephane Rombauts
Yves Van de Peer
Kamran Shalchian-Tabrizi
A2
Artikel in een tijdschrift
in
GENOME ANNOUNCEMENTS
2017
Draft genome sequences of two unclassified bacteria, Sphingomonas sp. strains IBVSS1 and IBVSS2, isolated from environmental samples
Russell J. S. Orr
Stephane Rombauts
Yves Van de Peer
Kamran Shalchian-Tabrizi
A2
Artikel in een tijdschrift
in
GENOME ANNOUNCEMENTS
2017
OMSim : a simulator for optical map data
Giles Miclotte
Stéphane Plaisance
Stephane Rombauts
Yves Van de Peer
P. Audenaert
Jan Fostier
A1
Artikel in een tijdschrift
in
BIOINFORMATICS
2017
2016
Complex evolutionary dynamics of massively expanded chemosensory receptor families in an extreme generalist chelicerate herbivore
Thi Ngoc Phuong Cao
Robert Greenhalgh
Wannes Dermauw
Stephane Rombauts
Sabina Bajda-Wybouw
Vladimir Zhurov
Miodrag Grbić
Yves Van de Peer
Thomas Van Leeuwen
Pierre Rouzé
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
GENOME BIOLOGY AND EVOLUTION
2016
Jabba: hybrid error correction for long sequencing reads
Giles Miclotte
Mahdi Heydari
Piet Demeester
Stephane Rombauts
Yves Van de Peer
P. Audenaert
Jan Fostier
A1
Artikel in een tijdschrift
in
ALGORITHMS FOR MOLECULAR BIOLOGY
2016
2015
Identifying prokaryotic consortia that live in close interactions with algae
Assia Saltykova
Sergio Pulido-Tamayo
Marie Pazoutova
Stefan A Rensing
Tomoaki Nishiyama
Yves Van de Peer
Kathleen Marchal
Stephane Rombauts
C3
Conferentie
2015
2014
An improved genome of the model marine alga Ostreococcus tauri unfolds by assessing Illumina de novo assemblies
Romain Blanc-Mathieu
Bram Verhelst
Evelyne Derelle
Stephane Rombauts
François-Yves Bouget
Isabelle Carre
Annie Chateau
Adam Eyre-Walker
Nigel Grimsley
Hervé Moreau
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
BMC GENOMICS
2014
The grapevine gene nomenclature system
Jérôme Grimplet
Anne-Françoise Adam-Blondon
Pierre-François Bert
Oliver Bitz
Dario Cantu
Christopher Davies
Serge Delrot
Mario Pezzotti
Stephane Rombauts
Grant R Cramer
A1
Artikel in een tijdschrift
in
BMC GENOMICS
2014
2013
A link between host plant adaptation and pesticide resistance in the polyphagous spider mite Tetranychus urticae
Wannes Dermauw
Nicky Wybouw
Stephane Rombauts
Björn Menten
John Vontas
Miodrag Grbić
Richard M Clark
René Feyereisen
Thomas Van Leeuwen
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
2013
Analysis of RNA-Seq data with TopHat and Cufflinks for genome-wide expression analysis of jasmonate-treated plants and plant cell cultures
Jacob Pollier
Stephane Rombauts
Alain Goossens
Hoofdstuk in een boek
in
Jasmonate signaling : methods and protocols
2013
Analysis of the olive fruit fly Bactrocera oleae transcriptome and phylogenetic classification of the major detoxification gene families
Nena Pavlidi
Wannes Dermauw
Stephane Rombauts
Antonis Chrisargiris
Thomas Van Leeuwen
John Vontas
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLOS ONE
2013
CathaCyc, a metabolic pathway database built from Catharanthus roseus RNA-Seq data
Alex Van Moerkercke
Michele Fabris
Jacob Pollier
Gino Baart
Stephane Rombauts
Ghulam Hasnain
Heiko Rischer
Johan Memelink
Kirsi-Marja Oksman-Caldentey
Alain Goossens
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT AND CELL PHYSIOLOGY
2013
Overview of tomato (Solanum lycopersicum) candidate pathogen recognition genes reveals important Solanum R locus dynamics
G Andolfo
W Sanseverino
Stephane Rombauts
Yves Van de Peer
JM Bradeen
D Carputo
L Frusciante
MR Ercolano
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NEW PHYTOLOGIST
2013
Reannotation and extended community resources for the genome of the non-seed plant Physcomitrella patens provide insights into the evolution of plant gene structures and functions
Andreas D Zimmer
Daniel Lang
Karol Buchta
Stephane Rombauts
Tomoaki Nishiyama
Mitsuyasu Hasebe
Yves Van de Peer
Stefan A Rensing
Ralf Reski
A1
Artikel in een tijdschrift
in
BMC GENOMICS
2013
2012
Gene functionalities and genome structure in Bathycoccus prasinos reflect cellular specializations at the base of the green lineage
Hervé Moreau
Bram Verhelst
Arnaud Couloux
Evelyne Derelle
Stephane Rombauts
Nigel Grimsley
Michiel Van Bel
Julie Poulain
Michaël Katinka
Martin F Hohmann-Marriott
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
GENOME BIOLOGY
2012
In silico cloning of genes encoding neuropeptides, neurohormones and their putative G-protein coupled receptors in a spider mite
Jan A Veenstra
Stephane Rombauts
Miodrag Grbić
A1
Artikel in een tijdschrift
in
INSECT BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY
2012
The metabolic blueprint of Phaeodactylum tricornutum reveals a eukaryotic Entner-Doudoroff glycolytic pathway
Michele Fabris
Michiel Matthijs
Stephane Rombauts
Wim Vyverman
Alain Goossens
Gino Baart
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT JOURNAL
2012
The tomato genome sequence provides insights into fleshy fruit evolution
Shusei Sato
Satoshi Tabata
Hideki Hirakawa
Erika Asamizu
Kenta Shirasawa
Sachiko Isobe
Takakazu Kaneko
Yasukazu Nakamura
Daisuke Shibata
Koh Aoki
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NATURE
2012
2011
Search for nodulation-related CLE genes in the genome of Glycine max
Virginie Mortier
Berhanu Amsalu Fenta
Cindy Martens
Stephane Rombauts
Marcella Holsters
Karl Kunert
Sofie Goormachtig
A1
Artikel in een tijdschrift
in
JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY
2011
The Medicago genome provides insight into the evolution of rhizobial symbioses
Nevin D Young
Frédéric Debellé
Giles ED Oldroyd
Rene Geurts
Steven B Cannon
Michael K Udvardi
Vagner A Benedito
Klaus FX Mayer
Jérôme Gouzy
Heiko Schoof
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NATURE
2011
The genome of Tetranychus urticae reveals herbivorous pest adaptations
Miodrag Grbić
Thomas Van Leeuwen
Richard M Clark
Stephane Rombauts
Pierre Rouzé
Vojislava Grbić
Edward J Osborne
Wannes Dermauw
Thi Ngoc Phuong Cao
Félix Ortego
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NATURE
2011
2010
AGRONOMICS1: A New Resource for Arabidopsis Transcriptome Profiling
Hubert Rehrauer
Catherine Aquino
Wilhelm Gruissem
Stefan R Henz
Pierre Hilson
Sascha Laubinger
Naïra Naouar
Andrea Patrignani
Stephane Rombauts
Huan Shu
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT PHYSIOLOGY
2010
CLE peptides control Medicago truncatula nodulation locally and systemically
Virginie Mortier
Griet Den Herder
Ryan Whitford
Willem Van De Velde
Stephane Rombauts
Katrien D'haeseleer
Marcella Holsters
Sofie Goormachtig
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT PHYSIOLOGY
2010
Functional modules in the Arabidopsis core cell cycle binary protein-protein interaction network
Joanna Boruc
Hilde Van Den Daele
Jens Hollunder
Stephane Rombauts
Evelien Mylle
Pierre Hilson
Dirk Inzé
Lieven De Veylder
Eugenia Russinova
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT CELL
2010
Systematic localization of the Arabidopsis core cell cycle proteins reveals novel cell division complexes
Joanna Boruc
Evelien Mylle
Maria Duda
Rebecca De Clercq
Stephane Rombauts
Danny Geelen
Pierre Hilson
Dirk Inzé
Daniël Van Damme
Eugenia Russinova
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT PHYSIOLOGY
2010
2009
A snapshot of the emerging tomato genome sequence
Lukas Mueller
René Klein Lankhorst
Steven D Tanksley
James J Giovannoni
Ruth White
Julia Vrebalov
Zhangjun Fei
Joyce van Eck
Robert Buels
Adri A Mills
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT GENOME
2009
Green evolution and dynamic adaptations revealed by genomes of the marine picoeukaryotes Micromonas
Alexandra Z Worden
Jea-Hyeok Lee
Thomas Mock
Pierre Rouzé
Melinda P Simmons
Andrea L Aerts
Andrew E Allen
Marie L Cuvelier
Evelyne Derelle
Meredith V Everett
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
SCIENCE
2009
Systematic analysis of cell-cycle gene expression during Arabidopsis development
Janice de Almeida Engler
Lieven De Veylder
Ruth De Groodt
Stephane Rombauts
Véronique Boudolf
Björn De Meyer
Adriana Hemerly
Paulo Ferreira
Tom Beeckman
Mansour Karimi
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
Plant Journal
2009
2008
Genome annotation in plants and fungi: EuGène as a model platform
Sylvain Foissac
Jérôme Gouzy
Stephane Rombauts
Catherine Mathé
Joëlle Amselem
Lieven Sterck
Yves Van de Peer
Pierre Rouzé
Thomas Schiex
A1
Artikel in een tijdschrift
in
CURRENT BIOINFORMATICS
2008
Genome-scale Arabidopsis promoter array identifies targets of the histone acetyltransferase GCN5
Moussa Benhamed
Marie-Laure Martin-Magniette
Ludivine Taconnat
Frédérique Bitton
Caroline Servet
Rebecca De Clercq
Björn De Meyer
Caroline Buysschaert
Stephane Rombauts
Raimundo Villarroel-Mandiola
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT JOURNAL
2008
Seven in absentia proteins affect plant growth and nodulation in Medicago truncatula
Griet Den Herder
Annick De Keyser
Riet De Rycke
Stephane Rombauts
Willem Van De Velde
María R Clemente
Christa Verplancke
Peter Mergaert
Eva Kondorosi
Marcella Holsters
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT PHYSIOLOGY
2008
The Physcomitrella genome reveals evolutionary insights into the conquest of land by plants
Stefan A Rensing
Daniel Lang
Andreas D Zimmer
Astrid Terry
Asaf Salamov
Harris Shapiro
Tomoaki Nishiyama
Pierre-François Perroud
Erika A Lindquist
Yasuko Kamisugi
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
SCIENCE
2008
2007
A molecular timetable for apical bud formation and dormancy induction in poplar
Tom Ruttink
Matthias Arend
Kris Morreel
Veronique Storme
Stephane Rombauts
Jörg Fromm
Rishikesh P Bhalerao
Wout Boerjan
Antje Rohde
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT CELL
2007
A symbiotic plant peroxidase involved in bacterial invasion of the tropical legume Sesbania rostrata
Jeroen Den Herder
Sam Lievens
Stephane Rombauts
Marcella Holsters
Sofie Goormachtig
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT PHYSIOLOGY
2007
Comparative transcriptome analysis reveals common and specific tags for root hair and crack-entry invasion in Sesbania rostrata
Ward Capoen
Jeroen Den Herder
Stephane Rombauts
Jeroen De Gussem
Annick De Keyser
Marcella Holsters
Sofie Goormachtig
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT PHYSIOLOGY
2007
How many genes are there in plants (... and why are they there)?
Lieven Sterck
Stephane Rombauts
Klaas Vandepoele
Pierre Rouzé
Yves Van de Peer
A1
Artikel in een tijdschrift
in
CURRENT OPINION IN PLANT BIOLOGY
2007
The annotation and analysis of the genome of Arabidopsis lyrata
Jeffrey Fawcett
Stephane Rombauts
Pedro Pattyn
Lieven Sterck
Yves Van de Peer
C3
Conferentie
2007
The tiny eukaryote Ostreococcus provides genomic insights into the paradox of plankton speciation
Brian Palenik
Jane Grimwood
Andrea Aerts
Pierre Rouzé
Asaf Salamov
Nicholas Putnam
Chris Dupont
Richard Jorgensen
Evelyne Derelle
Stephane Rombauts
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
2007
2006
Aging in legume symbiosis : a molecular view on nodule senescence in Medicago truncatula
Willem Van De Velde
Juan Carlos Pérez Guerra
Annick De Keyser
Riet De Rycke
Stephane Rombauts
Nicolas Maunoury
Peter Mergaert
Eva Kondorosi
Marcella Holsters
Sofie Goormachtig
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT PHYSIOLOGY
2006
Genome analysis of the smallest free-living eukaryote Ostreococcus tauri unveils many unique features
Evelyne Derelle
Conchita Ferraz
Stephane Rombauts
Pierre Rouzé
Alexandra Z Worden
Steven Robbens
Frédéric Partensky
Sven Degroeve
Sophie Echeynié
Richard Cooke
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
2006
Legume genome evolution viewed through the Medicago truncatula and Lotus japonicus genomes
Steven B Cannon
Lieven Sterck
Stephane Rombauts
Shusei Sato
Foo Cheung
Jérôme Gouzy
Xiaohong Wang
Joann Mudge
Jayprakash Vasdewani
Thomas Schiex
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
2006
The genome of black cottonwood, Populus trichocarpa (Torr. & Gray)
GA Tuskan
S DiFazio
S Jansson
J Bohlmann
I Grigoriev
U Hellsten
N Putnam
S Ralph
Stephane Rombauts
A Salamov
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
SCIENCE
2006
2005
EST data suggest that poplar is an ancient polyploid
Lieven Sterck
Stephane Rombauts
Stefan Jansson
Fredrik Sterky
Pierre Rouzé
Yves Van de Peer
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NEW PHYTOLOGIST
2005
GeneFarm, structural and functional annotation of Arabidopsis gene and protein families by a network of experts
Sébastien Aubourg
Véronique Brunaud
Clémence Bruyère
Mark Cock
Richard Cooke
Annick Cottet
Arnaud Couloux
Patrice Déhais
Gilbert Deléage
Aymeric Duclert
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NUCLEIC ACIDS RESEARCH
2005
Genome analysis of the world's smallest free-living eukaryote Ostreococcus tauri unveils unique genome heterogeneity
Steven Robbens
Stephane Rombauts
Pierre Rouzé
Jan Wuyts
Yvan Saeys
Hervé Moreau
Yves Van de Peer
C1
Conferentie
2005
Genome-wide analysis of hydrogen peroxide-regulated gene expression in Arabidopsis reveals a high light-induced transcriptional cluster involved in anthocyanin biosynthesis
Sandy Vanderauwera
Philip Zimmermann
Stephane Rombauts
Steven Vandenabeele
Christian Langebartels
Wilhelm Gruissem
Dirk Inzé
Frank Van Breusegem
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT PHYSIOLOGY
2005
2004
Annotation of a 95-kb Populus deltoides genomic sequence reveals a disease resistance gene cluster and novel class I and class II transposable elements
Magali Lescot
Stephane Rombauts
Jiong Zhang
Sébastien Aubourg
Catherine Mathé
S Jansson
Pierre Rouzé
Wout Boerjan
A1
Artikel in een tijdschrift
in
THEORETICAL AND APPLIED GENETICS
2004
Catalase deficiency drastically affects gene expression induced by high light in Arabidopsis thaliana
Steven Vandenabeele
Sandy Vanderauwera
Marnik Vuylsteke
Stephane Rombauts
Christian Langebartels
Harald K Seidlitz
Marc Zabeau
Marc Van Montagu
Dirk Inzé
Frank Van Breusegem
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT JOURNAL
2004
Starch division and partitioning: a mechanism for granule propagation and maintenance in the picophytoplanktonic green alga Ostreococcus tauri
Jean-Philippe Ral
Evelyne Derelle
Conchita Ferraz
Fabrice Wattebled
Benoit Farinas
Florence Corellou
Alain Buléon
Marie-Christine Slomianny
David Delvalle
Christophe d'Hulst
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT PHYSIOLOGY
2004
2003
AFLPinSilico, simulating AFLP fingerprints
Stephane Rombauts
Yves Van de Peer
Pierre Rouzé
A1
Artikel in een tijdschrift
in
BIOINFORMATICS
2003
Computational approaches to identify promoters and cis-regulatory elements in plant genomes
Stephane Rombauts
Kobe Florquin
Magali Lescot
Kathleen Marchal
Pierre Rouzé
Yves Van de Peer
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT PHYSIOLOGY
2003
Genomewide structural annotation and evolutionary analysis of the type I MADS-box genes in plants
Stefanie De Bodt
Jeroen Raes
Kobe Florquin
Stephane Rombauts
Pierre Rouzé
Günter Theißen
Yves Van de Peer
A1
Artikel in een tijdschrift
in
JOURNAL OF MOLECULAR EVOLUTION
2003
Microarray analysis of E2Fa-DPa-overexpressing plants uncovers a cross-talking genetic network between DNA replication and nitrogen assimilation
Kobe Vlieghe
Marnik Vuylsteke
Kobe Florquin
Stephane Rombauts
Sara Maes
Sandra Ormenese
Paul Van Hummelen
Yves Van de Peer
Dirk Inzé
Lieven De Veylder
A1
Artikel in een tijdschrift
in
JOURNAL OF CELL SCIENCE
2003
Quantitative cDNA-AFLP analysis for genome-wide expression studies
Peter Breyne
Rozemarijn Dreesen
Bernard Cannoot
Debbie Rombaut
Klaas Vandepoele
Stephane Rombauts
Rudy Vanderhaeghen
Dirk Inzé
Marc Zabeau
A1
Artikel in een tijdschrift
in
MOLECULAR GENETICS AND GENOMICS
2003
2002
A Gibbs sampling method to detect overrepresented motifs in the upstream regions of coexpressed genes
Gert Thijs
Kathleen Marchal
Magali Lescot
Stephane Rombauts
Bart De Moor
Pierre Rouzé
Yves Moreau
A1
Artikel in een tijdschrift
in
JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY
2002
Deciphering cis-acting regulatory elements in plant and drosophila promoter sequences
Magali Lescot
Gert Thijs
Stephane Rombauts
Patrice Déhais
David Martin
Denis Thieffry
Bernard Jacq
Yves Moreau
Pierre Rouzé
Jacques van Helden
C3
Conferentie
2002
Genome-wide analysis of core cell cycle genes in Arabidopsis
Klaas Vandepoele
Jeroen Raes
Lieven De Veylder
Pierre Rouzé
Stephane Rombauts
Dirk Inzé
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT CELL
2002
INCLUSive: INtegrated Clustering, Upstream of sequence retrieval and motif Sampling
Gert Thijs
Yves Moreau
Frank De Smet
Janick Mathys
Magali Lescot
Stephane Rombauts
Pierre Rouzé
Bart De Moor
Kathleen Marchal
A1
Artikel in een tijdschrift
in
BIOINFORMATICS
2002
Integrating quality-based clustering of microarray data with Gibbs sampling for the discovery of regulatory motifs
Yves Moreau
Gert Thijs
Kathleen Marchal
Frank De Smet
Janick Mathys
Magali Lescot
Stephane Rombauts
Pierre Rouzé
Bart De Moor
C1
Conferentie
2002
Moss transcriptome and beyond
Stefan A Rensing
Stephane Rombauts
Yves Van de Peer
Ralf Reski
Redactioneel materiaal
2002
PlantCARE, a database of plant cis-acting regulatory elements and a portal to tools for in silico analysis of promoter sequences
Magali Lescot
Patrice Déhais
Gert Thijs
Kathleen Marchal
Yves Moreau
Yves Van de Peer
Pierre Rouzé
Stephane Rombauts
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NUCLEIC ACIDS RESEARCH
2002
The PlantCARE database and tools for in silico search of plant cis-acting regulatory elements
Stephane Rombauts
Magali Lescot
Gert Thijs
Kathleen Marchal
Yves Moreau
Patrice Déhais
Yves Van de Peer
Pierre Rouzé
C3
Conferentie
2002
Transcriptome analysis during cell division in plants
Peter Breyne
Rozemarijn Dreesen
Klaas Vandepoele
Lieven De Veylder
Frank Van Breusegem
Lindy Callewaert
Stephane Rombauts
Jeroen Raes
Bernard Cannoot
Gilbert Engler
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
2002
2001
A higher-order background model improves the detection of promoter regulatory elements by Gibbs sampling
Gert Thijs
Magali Lescot
Kathleen Marchal
Stephane Rombauts
Bart De Moor
Pierre Rouzé
Yves Moreau
A1
Artikel in een tijdschrift
in
BIOINFORMATICS
2001
Identification of novel cyclin-dependent kinases interacting with the CKS1 protein of Arabidopsis
Véronique Boudolf
Stephane Rombauts
Mirande Naudts
Dirk Inzé
Lieven De Veylder
A1
Artikel in een tijdschrift
in
JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY
2001
In silico search of plant cis-acting regulatory elements
Magali Lescot
Stephane Rombauts
Gert Thijs
Kathleen Marchal
Bart De Moor
Yves Moreau
Pierre Rouzé
C1
Conferentie
2001
2000
Characterization of two distinct DP-related genes from Arabidopsis thaliana
Zoltán Magyar
Ana Atanassova
Lieven De Veylder
Stephane Rombauts
Dirk Inzé
A1
Artikel in een tijdschrift
in
FEBS LETTERS
2000
Detection of cis-acting regulatory elements in plants : a GIBBS sampling approach
Gert Thijs
Stephane Rombauts
Magali Lescot
Kathleen Marchal
Bart De Moor
Yves Moreau
Pierre Rouzé
C1
Conferentie
2000
Gene prediction and gene classes in Arabidopsis thaliana
Catherine Mathé
Patrice Déhais
Nathalie Pavy
Stephane Rombauts
Marc Van Montagu
Pierre Rouzé
A1
Artikel in een tijdschrift
in
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY
2000
1999
Evaluation of gene prediction software using a genomic data set: application to Arabidopsis thaliana sequences
Nathalie Pavy
Stephane Rombauts
Patrice Déhais
Catherine Mathé
Davuluri VV Ramana
Philippe Leroy
Pierre Rouzé
A1
Artikel in een tijdschrift
in
BIOINFORMATICS
1999
Evidence for an ancient chromosomal duplication in Arabidopsis thaliana by sequencing and analyzing a 400-kb contig at the APETALA2 locus on chromosome 4
Nancy Terryn
Leo Heijnen
Annick De Keyser
Martien Van Asseldonck
Rebecca De Clercq
Henk Verbakel
Jan Gielen
Marc Zabeau
Raimundo Villarroel-Mandiola
Taco Jesse
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
FEBS LETTERS
1999
Genome annotation: which tools do we have for it?
Pierre Rouzé
Nathalie Pavy
Stephane Rombauts
A1
Artikel in een tijdschrift
in
CURRENT OPINION IN PLANT BIOLOGY
1999
Génomique et bio-informatique
Nathalie Pavy
Catherine Mathé
Stephane Rombauts
Pierre Rouzé
A1
Artikel in een tijdschrift
in
OCL-OLEAGINEUX CORPS GRAS LIPIDES
1999
PlantCARE, a plant cis-acting regulatory element database
Stephane Rombauts
Patrice Déhais
Marc Van Montagu
Pierre Rouzé
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NUCLEIC ACIDS RESEARCH
1999
Recognition of gene regulatory sequences by bagging of neural networks
Gert Thijs
Yves Moreau
Stephane Rombauts
Bart De Moor
Pierre Rouzé
P1
Conferentie
1999
1996
Gene prediction in Arabidopsis thaliana: genomic sequences
Pierre Rouzé
Stephane Rombauts
G Van Laere
Luc Van Wiemeersch
Marc Van Montagu
A1
Artikel in een tijdschrift
in
ARCHIVES OF PHYSIOLOGY AND BIOCHEMISTRY
1996