Instellingen beheren
MENU
Over deze site
In English
Home
Onderzoekers
Projecten
Organisaties
Publicaties
Infrastructuur
Contact
Research Explorer
Uw browser ondersteunt geen JavaScript of JavaScript is niet ingeschakeld. Zonder JavaScript kan sommige functionaliteit van deze webapplicatie uitgeschakeld zijn of foutmeldingen veroorzaken. Raadpleeg om JavaScript in te schakelen de handleiding van uw browser of contacteer uw systeembeheerder.
Onderzoeker
Ramiro Vilchez Vargas
Profiel
Projecten
Publicaties
Activiteiten
Prijzen & Erkenningen
54
Resultaten
2018
Chronic rhinosinusitis with nasal polyps is characterized by dysbacteriosis of the nasal microbiota
Thanit Chalermwatanachai
Ramiro Vilchez Vargas
Gabriële Holtappels
Tim Lacoere
Ruy Jauregui
Frederiek-Maarten Kerckhof
Dietmar H Pieper
Tom Van de Wiele
Mario Vaneechoutte
Thibaut Van Zele
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
SCIENTIFIC REPORTS
2018
Initial evenness determines diversity and cell density dynamics in synthetic microbial ecosystems
Elham Ehsani
Emma Hernandez Sanabria
Frederiek-Maarten Kerckhof
Ruben Props
Ramiro Vilchez Vargas
Marius Vital
Dietmar H Pieper
Nico Boon
A1
Artikel in een tijdschrift
in
SCIENTIFIC REPORTS
2018
Microbial community changes induced by uranyl nitrate in bentonite clay microcosms
Margarita Lopez-Fernandez
Ramiro Vilchez Vargas
Fadwa Jroundi
Nico Boon
Dietmar Pieper
Mohamed L Merroun
A1
Artikel in een tijdschrift
in
APPLIED CLAY SCIENCE
2018
Microbial transplant to shift a malodorous armpit microbiome
Chris Callewaert
Frederiek-Maarten Kerckhof
Thomas Van Keer
Murielle Meunier
Tess Plaquet
Stijn Hawinkel
Maarten Aerts
Peter Vandamme
Emma Hernandez Sanabria
Jon Sanders
et al.
C3
Conferentie
2018
2017
High-fiber and high-protein diets shape different gut microbial communities, which ecologically behave similarly under stress conditions, as shown in a gastrointestinal simulator
Massimo Marzorati
Ramiro Vilchez Vargas
Julie Vanden Bussche
Pilar Truchado
Ruy Jauregui
Racha El Hage
Dietmar H Pieper
Lynn Vanhaecke
Tom Van de Wiele
A1
Artikel in een tijdschrift
in
MOLECULAR NUTRITION & FOOD RESEARCH
2017
In vitro colonisation of the distal colon by Akkermansia muciniphila is largely mucin and pH dependent
Florence Van Herreweghen
Pieter Van den Abbeele
Thijs De Mulder
Rosemarie De Weirdt
Annelies Geirnaert
Emma Hernandez Sanabria
Ramiro Vilchez Vargas
R Jauregui
DH Pieper
C Belzer
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
BENEFICIAL MICROBES
2017
Initial evenness determines temporal dynamics in synthetic microbial ecosystem
Elham Ehsani
Emma Hernandez Sanabria
Frederiek-Maarten Kerckhof
Ruben Props
Ramiro Vilchez Vargas
Marius Vital
Dietmar H Pieper
Nico Boon
C3
Conferentie
2017
Long chain arabinoxylans shift the mucosa-associated microbiota in the proximal colon of the simulator of the human intestinal microbial ecosystem (M-SHIME)
Maria del Pilar Truchado Gambao
Emma Hernandez Sanabria
Bouke N Salden
Pieter Van den Abbeele
Ramiro Vilchez Vargas
Ruy Jauregui
Dietmar H Pieper
Sam Possemiers
Tom Van de Wiele
A1
Artikel in een tijdschrift
in
JOURNAL OF FUNCTIONAL FOODS
2017
Mucosa-associated biohydrogenating microbes protect the simulated colon microbiome from stress associated with high concentrations of poly-unsaturated fat
Rosemarie De Weirdt
Emma Hernandez Sanabria
Veerle Fievez
Eva Mees
Annelies Geirnaert
Florence Van Herreweghen
Ramiro Vilchez Vargas
Pieter Van den Abbeele
Ruy Jauregui
Dietmar H Pieper
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY
2017
Ursodeoxycholic acid and its taurine/glycine conjugated species reduce colitogenic dysbiosis and equally suppress experimantal colitis in mice
Lien Van den Bossche
Pieter Hindryckx
Lindsey Devisscher
Sarah Devriese
Sophie Van Welden
Tom Holvoet
Ramiro Vilchez Vargas
Marius Vital
Dietmar Pieper
Julie Vanden Bussche
et al.
C3
Conferentie
2017
Ursodeoxycholic acid and its taurine/glycine conjugated species reduce colitogenic dysbiosis and equally suppress experimental colitis in mice
Lien Van den Bossche
Pieter Hindryckx
Lindsey Devisscher
Sarah Devriese
Sophie Van Welden
Tom Holvoet
Ramiro Vilchez Vargas
Marius Vital
Dietmar H Pieper
Julie Vandenbussche
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY
2017
Ursodeoxycholic acid and its taurine/glycine conjugated species reduce colitogenic dysbiosis and equally suppress experimental colitis in mice
Lien Van den Bossche
Pieter Hindryckx
Lindsey Devisscher
Sarah Devriese
Sophie Van Welden
Tom Holvoet
Ramiro Vilchez Vargas
Marius Vital
Dietmar H Pieper
Julie Vandenbussche
et al.
C3
Conferentie
2017
2016
A robust nitrifying community in a bioreactor at 50 °C opens up the path for thermophilic nitrogen removal
Emilie Courtens
Eva Spieck
Ramiro Vilchez Vargas
Samuel Bodé
Pascal Boeckx
Stefan Schouten
Ruy Jauregui
Dietmar H Pieper
Siegfried Vlaeminck
Nico Boon
A1
Artikel in een tijdschrift
in
ISME JOURNAL
2016
Characterisation of the human uterine microbiome in non-pregnant women through deep sequencing of the V1-2 region of the 16S rRNA gene
Hans Verstraelen
Ramiro Vilchez Vargas
Fabian Desimpel
Ruy Jauregui
NELE VANKEIRSBILCK
Steven Weyers
Rita Verhelst
Petra De Sutter
Dietmar H Pieper
Tom Van de Wiele
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PEERJ
2016
Community structure, population dynamics and diversity of fungi in a full-scale membrane bioreactor (MBR) for urban wastewater treatment
P Maza-Márquez
Ramiro Vilchez Vargas
Frederiek-Maarten Kerckhof
E Aranda
J González-López
B Rodelas
A1
Artikel in een tijdschrift
in
WATER RESEARCH
2016
Dietary supplement based on stilbenes : a focus on gut microbial metabolism by the in vitro simulator M-SHIME®
Camilla Giuliani
Massimo Marzorati
Marzia Innocenti
Ramiro Vilchez Vargas
Marius Vital
Dietmar H Pieper
Tom Van de Wiele
Nadia Mulinacci
A1
Artikel in een tijdschrift
in
FOOD & FUNCTION
2016
Draft genome sequence of Aeromonas sp. strain EERV15
Elham Ehsani
Israel Barrantes
Johanna Vandermaesen
Robert Geffers
Michael Jarek
Nico Boon
Dirk Springael
Dietmar H. Pieper
Ramiro Vilchez Vargas
A2
Artikel in een tijdschrift
in
MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS
2016
Empowering a mesophilic inoculum for thermophilic nitrification : growth mode and temperature pattern as critical proliferation factors for archaeal ammonia oxidizers
Emilie Courtens
Tom Vandekerckhove
Delphine Prat
Ramiro Vilchez Vargas
Marius Vital
Dietmar H Pieper
Ken Meerbergen
Bart Lievens
Nico Boon
Siegfried Vlaeminck
A1
Artikel in een tijdschrift
in
WATER RESEARCH
2016
High-rate activated sludge communities have a distinctly different structure compared to low-rate sludge communities, and are less sensitive towards environmental and operational variables
Francis Meerburg
Siegfried Vlaeminck
Hugo Roume
Dries Seuntjens
Dietmar H Pieper
Ruy Jauregui
Ramiro Vilchez Vargas
Nico Boon
A1
Artikel in een tijdschrift
in
WATER RESEARCH
2016
Microbial ecology of high-rate versus conventional activated sludge: environmental and operational parameters shape microbial structure, co-occurrence and functionality
Dries Seuntjens
Francis Meerburg
Siegfried Vlaeminck
Hugo Roume
Dietmar Pieper
Ruy Jaureguic
Ramiro Vilchez Vargas
Nico Boon
C3
Conferentie
2016
Mineral and organic growing media have distinct community structure, stability and functionality in soilless culture systems
Oliver Grunert
Emma Hernandez Sanabria
Ramiro Vilchez Vargas
Ruy Jauregui
Dietmar H Pieper
Maaike Perneel
Marie-Christine Van Labeke
Dirk Reheul
Nico Boon
A1
Artikel in een tijdschrift
in
SCIENTIFIC REPORTS
2016
Platinum recovery from synthetic extreme environments by halophilic bacteria
Synthia Maes
Ruben Props
Jeffrey P Fitts
Rebecca De Smet
Ramiro Vilchez Vargas
Marius Vital
Dietmar H Pieper
Frank Vanhaecke
Nico Boon
Tom Hennebel
A1
Artikel in een tijdschrift
in
ENVIRONMENTAL SCIENCE & TECHNOLOGY
2016
Presence does not imply activity : DNA and RNA patterns differ in response to salt perturbation in anaerobic digestion
Jo De Vrieze
Leticia Regueiro
Ruben Props
Ramiro Vilchez Vargas
Ruy Jáuregui
Dietmar H Pieper
Juan M Lema
Marta Carballa
A1
Artikel in een tijdschrift
in
BIOTECHNOLOGY FOR BIOFUELS
2016
Product diversity linked to substrate usage in chain elongation by mixed-culture fermentation
Marta Coma Bech
Ramiro Vilchez Vargas
Hugo Roume
Ruy Jauregui
Dietmar H Pieper
Korneel Rabaey
A1
Artikel in een tijdschrift
in
ENVIRONMENTAL SCIENCE & TECHNOLOGY
2016
The full-scale anaerobic digestion microbiome is represented by specific marker populations
Jo De Vrieze
Linde Raport
Hugo Roume
Ramiro Vilchez Vargas
Ruy Jauregui
Dietmar H Pieper
Nico Boon
A1
Artikel in een tijdschrift
in
WATER RESEARCH
2016
The ratio of metabolically active versus total Mycolata populations triggers foaming in a membrane bioreactor
P Maza-Márquez
Ramiro Vilchez Vargas
Nico Boon
J González-López
MV Martínez-Toledo
B Rodelas
A1
Artikel in een tijdschrift
in
WATER RESEARCH
2016
Transitioning from mesophilic to thermophilic nitrification : shaping a niche for archaeal ammonia oxidizers
Tom Vandekerckhove
Emilie Courtens
Delphine Prat
Ramiro Vilchez Vargas
Marius Vital
Dietmar H Pieper
Ken Meerbergen
Bart Lievens
Nico Boon
Siegfried Vlaeminck
C1
Conferentie
2016
2015
Bacterial diversity in bentonites, engineered barrier for deep geological disposal of radioactive wastes
Margarita Lopez-Fernandez
Andrea Cherkouk
Ramiro Vilchez Vargas
Ruy Jauregui
Dietmar Pieper
Nico Boon
Ivan Sanchez-Castro
Mahomed L Merroun
A1
Artikel in een tijdschrift
in
MICROBIAL ECOLOGY
2015
Draft genome sequence of Rhodococcus sp. Strain 311R
Elham Ehsani
Ruy Jauregui
Robert Geffers
Michael Jareck
Nico Boon
Dietmar H. Pieper
Ramiro Vilchez Vargas
A2
Artikel in een tijdschrift
in
MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS
2015
Enhancing microbial cryopreservation: from fastidious microbes to mixed communities
Frederiek-Maarten Kerckhof
Bram Vekeman
Annelies Geirnaert
Emilie Courtens
Ramiro Vilchez Vargas
Adrian Ho
Kim Heylen
Nico Boon
C3
Conferentie
2015
Inoculum selection is crucial to ensure operational stability in anaerobic digestion
Jo De Vrieze
Sylvia Gildemyn
Ramiro Vilchez Vargas
Ruy Jáuregui
Dietmar H Pieper
Willy Verstraete
Nico Boon
A1
Artikel in een tijdschrift
in
APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY
2015
Interindividual differences in response to treatment with butyrate-producing Butyricicoccus pullicaecorum 25–3T studied in an in vitro gut model
Annelies Geirnaert
Jun Wang
Magali Tinck
Alix Steyaert
Pieter Van den Abbeele
Venessa Eeckhaut
Ramiro Vilchez Vargas
Gwen Falony
Debby Laukens
Martine De Vos
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY
2015
Nitrogen removal in a moving bed membrane bioreactor for municipal sewage treatment: community differentiation in attached biofilm and suspended biomass
P Reboleiro-Rivas
J Martín-Pascual
B Juárez-Jiménez
JM Poyatos
Ramiro Vilchez Vargas
Siegfried Vlaeminck
B Rodelas
J González-López
A1
Artikel in een tijdschrift
in
CHEMICAL ENGINEERING JOURNAL
2015
2014
Draft genome sequence of the naphthalene degrader Herbaspirillum sp. strain RV1423
Ruy Jauregui
Belén Rodelas
Robert Geffers
Nico Boon
Dietmar H Pieper
Ramiro Vilchez Vargas
A4
Artikel in een tijdschrift
in
GENOME ANNOUNCEMENTS
2014
Optimized cryopreservation of mixed microbial communities for conserved functionality and diversity
Frederiek-Maarten Kerckhof
Emilie Courtens
Annelies Geirnaert
Sven Hoefman
Adrian Ho
Ramiro Vilchez Vargas
Dietmar H Pieper
Ruy Jauregui
Siegfried Vlaeminck
Tom Van de Wiele
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLOS ONE
2014
Trade-off between mesophilic and thermophilic denitrification: rates vs. sludge production, settleability and stability
Emilie Courtens
Siegfried Vlaeminck
Ramiro Vilchez Vargas
Arne Verliefde
Ruy Jauregui
Dietmar H Pieper
Nico Boon
A1
Artikel in een tijdschrift
in
WATER RESEARCH
2014
2013
Analysis of the microbial gene landscape and transcriptome for aromatic pollutants and alkane degradation using a novel internally calibrated microarray system
Ramiro Vilchez Vargas
Robert Geffers
María Suárez-Diez
Ianina Conte
Agnes Waliczek
Vanessa Sabrina Kaser
Monika Kralova
Howard Junca
Dieter H Pieper
A1
Artikel in een tijdschrift
in
ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY
2013
Draft genome sequence of Pseudomonas veronii strain 1YdBTEX2
Daiana de Lima-Morales
Diego Chaves-Moreno
Michael Jarek
Ramiro Vilchez Vargas
Ruy Jauregui
Dietmar H Pieper
A4
Artikel in een tijdschrift
in
GENOME ANNOUNCEMENTS
2013
2011
Characterization of bacterial communities exposed to Cr(III) and Pb(II) in submerged fixed-bed biofilms for groundwater treatment
Ramiro Vilchez Vargas
C Gómez-Silván
J Purswani
J González-López
B Rodelas
A1
Artikel in een tijdschrift
in
ECOTOXICOLOGY
2011
2010
A poke into the diversity and associations within human anterior nare microbial communities
Melissa L Wos-Oxley
Iris Plumeier
Christof von Eiff
Stefan Taudien
Matthias Platzer
Ramiro Vilchez Vargas
Karsten Becker
Dietmar H Pieper
A1
Artikel in een tijdschrift
in
ISME JOURNAL
2010
Mangrove microniches determine the structural and functional diversity of enriched petroleum hydrocarbon-degrading consortia
Newton CM Gomes
Cecilia G Flocco
Rodrigo Costa
Howard Junca
Ramiro Vilchez Vargas
Dietmar H Pieper
Ellen Krögerrecklenfort
Rodolfo Paranhos
Leda CS Mendonca-Hagler
Kornelia Smalla
A1
Artikel in een tijdschrift
in
FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY
2010
Metabolic networks, microbial ecology and 'omics' technologies: towards understanding in situ biodegradation processes
Ramiro Vilchez Vargas
Howard Junca
Dietmar H Pieper
A1
Artikel in een tijdschrift
in
ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY
2010
Streptococcus mutans inhibits Candida albicans hyphal formation by the fatty acid signaling molecule trans-2-decenoic acid (SDSF)
Ramiro Vilchez Vargas
André Lemme
Britta Ballhausen
Verena Thiel
Stefan Schulz
Rolf Jansen
Helena Sztajer
Irene Wagner-Döbler
A1
Artikel in een tijdschrift
in
CHEMBIOCHEM
2010
2009
Degradation of chloroaromatics by Pseudomonas putida GJ31: assembled route for chlorobenzene degradation encoded by clusters on plasmid pKW1 and the chromosome
Markus Kunze
Kay F Zerlin
Alexander Retzlaff
Jens O Pohl
Eberhard Schmidt
Dick B Janssen
Ramiro Vilchez Vargas
Dietmar H Pieper
Walter Reineke
A1
Artikel in een tijdschrift
in
MICROBIOLOGY-SGM
2009
Identification, quantification, and determination of the absolute configuration of the bacterial quorum-sensing signal autoinducer-2 by gas chromatography-mass spectrometry
Verena Thiel
Ramiro Vilchez Vargas
Helena Sztajer
Irene Wagner-Döbler
Stefan Schulz
A1
Artikel in een tijdschrift
in
CHEMBIOCHEM
2009
2008
Autoinducer-2-regulated genes in Streptococcus mutans UA159 and global metabolic effect of the luxS mutation
Helena Sztajer
André Lemme
Ramiro Vilchez Vargas
Stefan Schulz
Robert Geffers
Cindy Ying Yin Yip
Celine M Levesque
Dennis G Cvitkovitch
Irene Wagner-Döbler
A1
Artikel in een tijdschrift
in
JOURNAL OF BACTERIOLOGY
2008
2007
Analysing traces of autoinducer-2 requires standardization of the Vibrio harveyi bioassay
Ramiro Vilchez Vargas
André Lemme
Verena Thiel
Stefan Schulz
Helena Sztajer
Irene Wagner-Döbler
A1
Artikel in een tijdschrift
in
ANALYTICAL AND BIOANALYTICAL CHEMISTRY
2007
Dominance of sphingomonads in a copper-exposed biofilm community for groundwater treatment
Ramiro Vilchez Vargas
C Pozo
MA Gómez
B Rodelas
J González-López
A1
Artikel in een tijdschrift
in
MICROBIOLOGY-SGM
2007
Effect of the concentration of suspended solids on the enzymatic activities and biodiversity of a submerged membrane bioreactor for aerobic treatment of domestic wastewater
M Molina-Muñoz
JM Poyatos
Ramiro Vilchez Vargas
E Hontoria
B Rodelas
J González-López
A1
Artikel in een tijdschrift
in
APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY
2007
Rejection of endocrine disrupting compounds (bisphenol A, bisphenol F and triethyleneglycol dimethacrylate) by membrane: technologies
M Gómez
G Garralón
F Plaza
Ramiro Vilchez Vargas
E Hontoria
MA Gómez
A1
Artikel in een tijdschrift
in
DESALINATION
2007
Removal of organic load from olive washing water by an aerated submerged biofilter and profiling of the bacterial community involved in the process
Clementina Pozo
Belén Rodelas
M Victoria Martínez-Toledo
Ramiro Vilchez Vargas
Jesús González-López
A1
Artikel in een tijdschrift
in
JOURNAL OF MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY
2007
2006
Analysis of community composition of biofilms in a submerged filter system for the removal of ammonia and phenol from industrial wastewater
C Cortés-Lorenzo
ML Molina-Muñoz
B Gómez-Villalba
Ramiro Vilchez Vargas
A Ramos
B Rodelas
E Hontoria
J González-López
A1
Artikel in een tijdschrift
in
BIOCHEMICAL SOCIETY TRANSACTIONS
2006
TGGE analysis of the diversity of ammonia-oxidizing and denitrifying bacteria in submerged filter biofilms for the treatment of urban wastewater
B Gómez-Villalba
C Calvo
Ramiro Vilchez Vargas
J González-López
B Rodelas
A1
Artikel in een tijdschrift
in
APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY
2006
2002
Yield production, chemical composition, and functional properties of emulsifier H28 synthesized by Halomonas eurihalina strain H-28 in media containing various hydrocarbons
F Martínez-Checa
FL Toledo
Ramiro Vilchez Vargas
E Quesada
C Calvo
A1
Artikel in een tijdschrift
in
APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY
2002