Research Explorer

Uw browser ondersteunt geen JavaScript of JavaScript is niet ingeschakeld. Zonder JavaScript kan sommige functionaliteit van deze webapplicatie uitgeschakeld zijn of foutmeldingen veroorzaken. Raadpleeg om JavaScript in te schakelen de handleiding van uw browser of contacteer uw systeembeheerder.

Onderzoeker

Maté Ongenaert

54 Resultaten

2018

A high-throughput 3’ UTR reporter screening identifies microRNA interactomes of cancer genes

Gert Van PeerEvelien MetsShana ClaeysInes De PuntSteve LefeverMaté OngenaertPieter RondouFranki SpelemanPieter MestdaghJo Vandesompele

A1 Artikel in een tijdschrift in PLOS ONE

Integrated transcriptomic and epigenomic analysis of ovarian cancer reveals epigenetically silenced GULP1

Leonel MaldonadoMariana BraitEvgeny IzumchenkoShahnaz BegumAditi ChatterjeeTanusree SenMyriam LoyoAlvaro BarbosaMaria Luana PoetaEugene MakarevAlex ZhavoronkovVito M FazioRoberto AngioliCarla RabittiMaté OngenaertWim Van CriekingeMaartje G NoordhuisPauline de GraeffG Bea A WismannAte GJ van der ZeeMohammad O Hoque

A1 Artikel in een tijdschrift in CANCER LETTERS

2017

Stage 4S neuroblastoma tumors show a characteristic DNA methylation portrait

Anneleen DecockMaté OngenaertBram De WildeBénédicte BrichardRosa NogueraFranki SpelemanJo Vandesompele

2016

DNA methylation profiling of primary neuroblastoma tumors using methyl-CpG-binding domain sequencing

Anneleen DecockMaté OngenaertWim Van CriekingeFranki SpelemanJo Vandesompele

A1 Artikel in een tijdschrift in SCIENTIFIC DATA

Exploring the neuroblastoma DNA methylome: from biology to biomarker

Anneleen DecockJo VandesompeleFranki SpelemanMaté Ongenaert

Methyl-CpG-binding domain sequencing reveals a prognostic methylation signature in neuroblastoma

Anneleen DecockMaté OngenaertRobrecht CannoodtKimberly VerniersBram De WildeGenevieve LaureysNadine Van RoyAna Pilar BerbegallJulie Bienertova-VaskuNick BownNathalie ClémentValérie CombaretMichelle HaberClaire HoyouxJayne MurrayRosa NogueraGaëlle PierronGudrun SchleiermacherJohannes H SchulteRay L StallingsDeborah A TweddleKatleen De PreterFranki SpelemanJo Vandesompele

A1 Artikel in een tijdschrift in ONCOTARGET

Methyl-CpG-binding domain sequencing reveals a prognostic methylation signature in neuroblastoma

Anneleen DecockMaté OngenaertRobrecht CannoodtKimberly VerniersBram De WildeGenevieve LaureysNadine Van RoyAna Pilar BerbegallJulie Bienertova-VaskuNick BownNathalie ClémentValérie CombaretMichelle HaberClaire HoyouxJayne MurrayRosa NogueraGaëlle PierronGudrun SchleiermacherJohannes H SchulteRay L StallingsDeborah A TweddleKatleen De PreterFranki SpelemanJo Vandesompele

Stage 4S neuroblastoma tumors show a characteristic DNA methylation portrait

Anneleen DecockMaté OngenaertBram De WildeBénédicte BrichardRosa NogueraFranki SpelemanJo Vandesompele

A1 Artikel in een tijdschrift in EPIGENETICS

2015

Characterization of the genome-wide TLX1 binding profile in T-cell acute lymphoblastic leukemia

Kaat DurinckWouter Van LoockeJoni Van der MeulenInge Van de WalleMaté OngenaertPieter RondouAnnelynn WallaertCE de BockNadine Van RoyBruce PoppeJ CoolsJ SoulierTom TaghonFranki SpelemanPieter Van Vlierberghe

A1 Artikel in een tijdschrift in LEUKEMIA

Genome wide expression profiling of p53 regulated miRNAs in neuroblastoma

Ali RihaniAlan Van GoethemMaté OngenaertSara De BrouwerPieter-Jan VoldersSaurabh AgarwalKatleen De PreterPieter MestdaghJason ShohetFranki SpelemanJo VandesompeleTom Van Maerken

A1 Artikel in een tijdschrift in SCIENTIFIC REPORTS

Hidden genetic variation in LCA9-associated congenital blindness explained by 5′UTR mutations and copy-number variations of NMNAT1

Frauke CoppietersAnne Laure TodeschiniTakuro FujimakiAnnelot BaertMarieke De BruyneCaroline Van CauwenberghHannah VerdinMiriam BauwensMaté OngenaertMineo KondoFrançoise MeireAkira MurakamiReiner A VeitiaBart LeroyElfride De Baere

A1 Artikel in een tijdschrift in HUMAN MUTATION

Methyl-CpG-binding domain sequencing reveals a prognostic methylation signature in neuroblastoma

Anneleen DecockMaté OngenaertRobrecht CannoodtKimberly VerniersBram De WildeGenevieve LaureysNadine Van RoyAna Pilar BerbegallJulie Bienertova-VaskuNick BownNathalie ClémentValérie CombaretMichelle HaberClaire HoyouxJayne MurrayRosa NogueraGaelle PierronGudrun SchleiermacherJohannes H SchulteRay L StallingsDeborah A TweddleKatleen De PreterFranki SpelemanJo Vandesompele

2014

Genome-wide methylation analysis unravels differential DNA methylation patterns between (prognostic) neuroblastoma patient subgroups

Anneleen DecockMaté OngenaertAna BerbegallRosa NogueraJayne MurrayMichele HaberRaymond L StallingsJohannes H SchulteValérie CombaretGudrun SchleiermacherNathalie ClémentDeborah TweddleKatleen De PreterFranki SpelemanJo Vandesompele

Integrative analysis of the NOTCH1 regulatory network identifies key downstream lncRNAs in acute T-cell lymphoblastic leukemia and normal T-cell development

Annelynn WallaertKaat DurinckPieter RondouInge Van de WalleWouter Van LoockePieter-Jan VoldersMaté OngenaertNadine Van RoyBruce PoppeYves BenoitJo VandesompeleTom TaghonPieter Van VlierbergheFranki Speleman

Promoter DNA-methylation in the TH-MYCN neuroblastoma mouse model

Anneleen BeckersWouter Van LoockeAnneleen DecockMaté OngenaertJo VandesompeleFranki SpelemanKatleen De Preter

The NOTCH1 driven long non-coding RNA repertoire in T-cell acute lymphoblastic leukemia

Annelynn WallaertKaat DurinckPieter RondouInge Van de WalleWouter VanloockePieter-Jan VoldersSuzanne VanhauwaertEllen GeerdensMaté OngenaertNadine Van RoyBruce PoppeYves BenoitJan CoolsJo VandesompeleJean SoulierPieter Van VlierbergheTom TaghonFranki Speleman

miRBase Tracker : keeping track of microRNA annotation changes

Gert Van PeerSteve LefeverJasper AnckaertAnneleen BeckersAli RihaniAlan Van GoethemPieter-Jan VoldersFjoralba ZekaMaté OngenaertPieter MestdaghJo Vandesompele

A1 Artikel in een tijdschrift in DATABASE-THE JOURNAL OF BIOLOGICAL DATABASES AND CURATION

2013

Expanding the TLX1 regulate in T-cell acute lymphoblastic leukemia towards long non-coding RNAs

Kaat DurinckJONI VAN DER MEULENMaté OngenaertPieter-Jan VoldersAnnelynn WallaertNadine Van RoyYves BenoitBruce PoppePieter MestdaghJo VandesompelePieter RondouJean SoulierPieter Van VlierbergheFranki Speleman

Expanding the TLX1-regulome in T cell acute lymphoblastic leukemia towards long non-coding RNAs

Kaat DurinckJoni Van der MeulenMaté OngenaertPieter-Jan VoldersAnnelynn WallaertNadine Van RoyYves BenoitBruce PoppePieter MestdaghJo VandesompelePieter RondouJean SoulierPieter Van VlierbergheFranki Speleman

Genome wide expression, mutation and methylation analysis validates three new mouse models for neuroblastoma targeting MYCN, ALK and LIN28B for pre-clinical studies

Anneleen BeckersBram De WildeMaté OngenaertCandy KumpsJohannes H SchulteJo VandesompeleKatleen De PreterFranki Speleman

Genome-wide promoter methylation analysis in neuroblastoma identifies prognostic methylation biomarkers

Anneleen DecockMaté OngenaertJasmien HoebeeckKatleen De PreterGert Van PeerWim Van CriekingeRuth LadensteinJohannes H SchulteRosa NogueraRaymond L StallingsAn Van DammeGenevieve LaureysJoëlle VermeulenTom Van MaerkenFranki SpelemanJo Vandesompele

Genome-wide promoter methylation analysis in neuroblastoma identifies prognostic methylation biomarkers

Anneleen DecockMaté OngenaertJasmien HoebeeckKatleen De PreterGert Van PeerWim Van CriekingeRuth LadensteinJohannes H SchulteRosa NogueraRaymond L StallingsAn Van DammeGenevieve LaureysTom Van MaerkenFranki SpelemanJo Vandesompele

Identifying and validating DNA methylation biomarkers: the example of neuroblastoma

Anneleen DecockMaté OngenaertJasmien HoebeeckKatleen De PreterGert Van PeerWim Van CriekingeRuth LadensteinJohannes H SchulteRosa NogueraRaymond L StallingsAn Van DammeGenevieve LaureysJoëlle VermeulenTom Van MaerkenFranki SpelemanJo Vandesompele

Methylation-specific digital karyotyping of HPV16E6E7 expressing human keratinocytes identifies novel methylation events in cervical carcinogenesis

Renske DM SteenbergenMaté OngenaertSuzanne SnellenbergGeert TrooskensWendy F van der MeideDeeksha PandeyNoga Bloushtain-QimronKornelia PolyakChris JLM MeijerPeter JF SnijdersWim Van Criekinge

A1 Artikel in een tijdschrift in JOURNAL OF PATHOLOGY

Novel TAL1 targets beyond protein-coding genes: identification of TAL1-regulated microRNAs in T-cell acute lymphoblastic leukemia

Nadia C CorreiaKaat DurinckAP LeiteMaté OngenaertPieter RondouFranki SpelemanFJ EnquitaJoão T Barata

A1 Artikel in een tijdschrift in LEUKEMIA

The MYCN driven murine and human neuroblastoma methylome and dynamic regulation of chromatin regulators as a guide for epigenetic therapy

Anneleen BeckersAnneleen DecockBelamy CheungDaniel CarterGert Van PeerSara De BrouwerGenevieve LaureysJo VandesompeleJohannes H SchulteGlenn MarshallMaté OngenaertKatleen De PreterFranki Speleman

2012

Genome-wide promoter methylation analysis in neuroblastoma identifies prognostic methylation biomarkers.

Anneleen DecockMaté OngenaertJasmien HoebeeckKatleen De PreterGert Van PeerWim Van CriekingeRuth LadensteinJohannes H SchulteRosa NogueraRaymond L StallingsAn Van DammeGenevieve LaureysJoëlle VermeulenTom Van MaerkenFranki SpelemanJo Vandesompele

A1 Artikel in een tijdschrift in GENOME BIOLOGY

Mapping the neuroblastoma epigenome

Maté OngenaertAnneleen DecockJo VandesompeleFranki Speleman

Mapping the neuroblastoma epigenome: perspectives for improved prognostic biomarkers

Maté OngenaertAnneleen DecockGenevieve LaureysJo VandesompeleFranki Speleman

Mapping the neuroblastoma epigenome: perspectives for improved prognostic biomarkers

Maté OngenaertAnneleen DecockJo VandesompeleFranki Speleman

MiR-137 is epigenetically silenced in MYCN amplified neuroblastomas and targets the polycomb repressive complex 2 (PRC2) component EZH2

Anneleen BeckersMaté OngenaertAnneleen DecockCandy KumpsFilip Pattynthe Neuroblastoma Research Consortium (NRC)Pieter MestdaghJohannes H SchulteFranki SpelemanKatleen De Preter

Promoter methylation analysis identifies prognostic methylation biomarkers in neuroblastoma

Anneleen DecockMaté OngenaertJasmien HoebeeckKatleen De PreterGert Van PeerWim Van CriekingeRuth LadensteinJohannes H SchulteRosa NogueraRaymond L StallingsAn Van DammeGenevieve LaureysJoëlle VermeulenTom Van MaerkenFranki SpelemanJo Vandesompele

Semi-high-throughput epigenetic validation using MSP on a real-time qPCR platform

Anneleen DecockMaté OngenaertJo VandesompeleFranki Speleman

2011

Exploring the neuroblastoma methylome using MBD2-seq

Maté OngenaertAnneleen DecockJo VandesompeleFranki Speleman

Jasmonate response of the Nicotiana tabacum agglutinin promoter in Arabidopsis thaliana

Annelies DelporteNausicaä LannooGianni VandenborreMaté OngenaertEls Van Damme

A1 Artikel in een tijdschrift in PLANT PHYSIOLOGY AND BIOCHEMISTRY

Mapping the neuroblastoma epigenome

Maté OngenaertAnneleen DecockJo VandesompeleFranki Speleman

Neuroblastoma epigenetics : from candidate gene approaches to genome-wide screenings

Anneleen DecockMaté OngenaertJo VandesompeleFranki Speleman

A1 Artikel in een tijdschrift in EPIGENETICS

Semi-high throughput epigenetic validation using MSP on a real-time qPCR platform

Anneleen DecockMaté OngenaertJo VandesompeleFranki Speleman

Semi-high throughput epigenetic validation using MSP on a real-time qPCR platform

Anneleen DecockMaté OngenaertJo VandesompeleFranki Speleman

The microRNA body map : dissecting microRNA function through integrative genomics

Pieter MestdaghSteve LefeverFilip PattynDana RidzonErik FredlundAnnelies FieuwMaté OngenaertJoëlle VermeulenAnne De PaepeLinda WongFranki SpelemanCaiFu ChenJo Vandesompele

A1 Artikel in een tijdschrift in NUCLEIC ACIDS RESEARCH

2010

GULP1, a potential tumor suppressor gene in ovarian tumors and its utility as a biomarker

Leonel MaldonadoMariana BraitShahnaz BegumAditi ChatterjeeMyriam LoyoAlvaro BarbosaM Luana PoetaVito M FazioAngioli RobertoElisabetta TarquiniWim Van CriekingeMaté OngenaertG Bea A WismanPauline de GraeffAte Van der ZeeDavid SidranskyMohammad Hoque

Integrating automated literature searches and text mining in biomarker discovery

Maté OngenaertLuc Dehaspe

The N-myc downstream regulated gene (NDRG) family: diverse functions, multiple applications

Veerle MelotteXianghu QuMaté OngenaertWim Van CriekingeAdriaan P de BruineH Scott BaldwinManon van Engeland

A1 Artikel in een tijdschrift in FASEB JOURNAL

2009

Cellular reprogramming

Maté OngenaertWim Van Criekinge

Critical evaluation of the use of bioinformatics as a theoretical tool to find high-potential sources of ACE inhibitory peptides

Lieselot VercruysseGuy SmaggheArie van der BentAart van AmerongenMaté OngenaertJohn Van Camp

A1 Artikel in een tijdschrift in PEPTIDES

Proteins with an Euonymus lectin-like domain are ubiquitous in Embryophyta

Elke FouquaertWilly J PeumansTom VandekerckhoveMaté OngenaertEls Van Damme

A1 Artikel in een tijdschrift in BMC PLANT BIOLOGY

2008

Discovery of DNA methylation markers in cervical cancer using relaxation ranking

Maté OngenaertG Bea A WismanHaukeline H VoldersAlice J KoningAte GJ van der ZeeWim Van CriekingeEd Schuuring

A1 Artikel in een tijdschrift in BMC MEDICAL GENOMICS

Genome-wide promoter analysis uncovers portions of the cancer methylome

MO HOQUEMS KIMKL OSTROWJ LIUGBA WISMANHL PARKML POETAC JERONIMOR HENRIQUEA LENDVAIE SCHUURINGS BEGUME ROSENBAUMMaté OngenaertK YAMASHITAJ CALIFANOW WESTRAAGJ VAN DER ZEEWim Van CriekingeD SIDRANSKY

A1 Artikel in een tijdschrift in CANCER RESEARCH

PubMeth: a cancer methylation database combining text-mining and expert annotation

Maté OngenaertLeander Van NesteTim De MeyerGerben MenschaertSofie BekaertWim Van Criekinge

A1 Artikel in een tijdschrift in NUCLEIC ACIDS RESEARCH

Pubmeth: reviewed methylation database in cancer based on text-mining

Maté OngenaertLeander Van NesteTim De MeyerGerben MenschaertSofie BekaertWim Van Criekinge

2007

Discovery of methylation markers using a relaxation ranking algorithm

Maté OngenaertWim Van CriekingeJ STRAUBA VAN DER ZEEE SCHUURINGH SPOLDERSB WISMAN

Genome wide promoter methylation analysis in neuroblastoma with perspectives for integrated molecular profiling

Jasmien HoebeeckMaté OngenaertEvi MichelsKatleen De PreterJoëlle VermeulenNurten YigitAnne De PaepeWim Van CriekingeFranki SpelemanJo Vandesompele

Phylogenetic and specificity studies of two-domain GNA-related lectins: generation of multispecificity through domain duplication and divergent evolution

Els Van DammeS NAKAMURA-TSURUTADF SMITHMaté OngenaertHC WINTERP ROUGEIJ GOLDSTEINH MOJ KOMINAMIR CULERRIERA BARREJ HIRABAYASHIWJ PEUMANS

A1 Artikel in een tijdschrift in BIOCHEMICAL JOURNAL

2005

CpG island characterisation

Maté OngenaertWim Van Criekinge