Research Explorer

Uw browser ondersteunt geen JavaScript of JavaScript is niet ingeschakeld. Zonder JavaScript kan sommige functionaliteit van deze webapplicatie uitgeschakeld zijn of foutmeldingen veroorzaken. Raadpleeg om JavaScript in te schakelen de handleiding van uw browser of contacteer uw systeembeheerder.

Onderzoeker

Marieke Vromman

Prijzen & Erkenningen

11 Resultaten

2023

Chasing circles : developing a toolbox for circRNA detection and validation

Marieke VrommanJo VandesompelePieter-Jan Volders

Circular RNA detection pipelines yield divergent sets of circular RNAs

Marieke VrommanJo Vandesompele

Redactioneel materiaal

Large-scale benchmarking of circRNA detection tools reveals large differences in sensitivity but not in precision

Marieke VrommanJasper AnckaertStefania BortoluzziAlessia BuratinChia-Ying ChenQinjie ChuTrees-Juen ChuangRoozbeh DehghannasiriChristoph DieterichXin Dong et al.

A1 Artikel in een tijdschrift in NATURE METHODS

2022

CIRCprimerXL : convenient and high-throughput PCR primer design for circular RNA quantification

Marieke VrommanJasper AnckaertJo VandesompelePieter-Jan Volders

A2 Artikel in een tijdschrift in FRONTIERS IN BIOINFORMATICS

CiLiQuant : quantification of RNA junction reads based on their circular or linear transcript origin

Annelien MorlionEva HulstaertMarieke VrommanJasper AnckaertCeline EveraertJo VandesompelePieter Mestdagh

A2 Artikel in een tijdschrift in FRONTIERS IN BIOINFORMATICS

Large-scale benchmarking of circular RNA detection tools

Marieke VrommanJo VandesompelePieter-Jan Volders

2021

Closing the circle : current state and perspectives of circular RNA databases

Marieke VrommanJo VandesompelePieter-Jan Volders

A1 Artikel in een tijdschrift in BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS

Large-scale benchmarking of circular RNA detection tools

Marieke VrommanJo VandesompelePieter-Jan Volders

The RNA Atlas expands the catalog of human non-coding RNAs

Lucia LorenziHua-Sheng ChiuFrancisco Avila CobosStephen GrossPieter-Jan VoldersRobrecht CannoodtJustine NuytensKatrien VanderheydenJasper AnckaertSteve Lefever et al.

A1 Artikel in een tijdschrift in NATURE BIOTECHNOLOGY

The RNA Atlas expands the catalog of human non-coding RNAs (June, 10.1038/s41587-021-00936-1, 2021)

Lucia LorenziHua-Sheng ChiuFrancisco Avila CobosStephen GrossPieter-Jan VoldersRobrecht CannoodtJustine NuytensKatrien VanderheydenJasper AnckaertSteve Lefever et al.

Validation of circular RNAs using RT‐qPCR after effective removal of linear RNAs by ribonuclease R

Marieke VrommanNurten YigitKimberly VerniersSteve LefeverJo VandesompelePieter-Jan Volders

A2 Artikel in een tijdschrift in CURRENT PROTOCOLS