Instellingen beheren
MENU
Over deze site
In English
Home
Onderzoekers
Projecten
Organisaties
Publicaties
Infrastructuur
Contact
Research Explorer
Uw browser ondersteunt geen JavaScript of JavaScript is niet ingeschakeld. Zonder JavaScript kan sommige functionaliteit van deze webapplicatie uitgeschakeld zijn of foutmeldingen veroorzaken. Raadpleeg om JavaScript in te schakelen de handleiding van uw browser of contacteer uw systeembeheerder.
Onderzoeker
Frederik Coppens
Profiel
Projecten
Publicaties
Activiteiten
Prijzen & Erkenningen
52
Resultaten
2023
Galaxy Training : a powerful framework for teaching!
Saskia Hiltemann
Helena Rasche
Simon Gladman
Hans-Rudolf Hotz
Delphine Larivière
Daniel Blankenberg
Pratik D. Jagtap
Thomas Wollmann
Anthony Bretaudeau
Nadia Goué
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY
2023
2022
Adenosine monophosphate deaminase modulates BIN2 activity through hydrogen peroxide-induced oligomerization
Qing Lu
Anaxi Houbaert
Qian Ma
Jingjing Huang
Lieven Sterck
Cheng Zhang
René Benjamins
Frederik Coppens
Frank Van Breusegem
Eugenia Russinova
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT CELL
2022
ELIXIR biovalidator for semantic validation of life science metadata
Isuru Liyanage
Tony Burdett
Bert Droesbeke
Karoly Erdos
Rolando Fernandez
Alasdair Gray
Muhammad Haseeb
Simon Jupp
Flavia Penim
Cyril Pommier
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
BIOINFORMATICS
2022
Expanding the Galaxy’s reference data
Nagampalli VijayKrishna
Jayadev Joshi
Nate Coraor
Jennifer Hillman-Jackson
Dave Bouvier
Marius van den Beek
Ignacio Eguinoa
Frederik Coppens
John Davis
Michał Stolarczyk
et al.
A2
Artikel in een tijdschrift
in
BIOINFORMATICS ADVANCES
2022
Galaxy: A Decade of Realising CWFR Concepts
Beatriz Serrano-Solano
Anne Fouilloux
Ignacio Eguinoa
Matus Kalas
Bjoern Gruening
Frederik Coppens
U
Artikel in een tijdschrift
in
DATA INTELLIGENCE
2022
PLAZA 5.0 : extending the scope and power of comparative and functional genomics in plants
Michiel Van Bel
Francesca Silvestri
Eric M Weitz
Lukasz Kreft
Alexander Botzki
Frederik Coppens
Klaas Vandepoele
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NUCLEIC ACIDS RESEARCH
2022
Packaging research artefacts with RO-Crate
Stian Soiland-Reyes
Peter Sefton
Mercè Crosas
Leyla Jael Castro
Frederik Coppens
José M. Fernández
Daniel Garijo
Björn Grüning
Marco La Rosa
Simone Leo
et al.
A2
Artikel in een tijdschrift
in
DATA SCIENCE
2022
Self-incompatibility requires GPI anchor remodeling by the poppy PGAP1 ortholog HLD1
Zongcheng Lin
Fei Xie
Marina Muñoz Triviño
Tao Zhao
Frederik Coppens
Lieven Sterck
Maurice Bosch
Vernonica E. Franklin-Tong
Moritz Nowack
A1
Artikel in een tijdschrift
in
CURRENT BIOLOGY
2022
Ten simple rules for making a software tool workflow-ready
Paul Brack
Peter Crowther
Stian Soiland-Reyes
Stuart Owen
Douglas Lowe
Alan R. Williams
Quentin Groom
Mathias Dillen
Frederik Coppens
Björn Grüning
et al.
Redactioneel materiaal
2022
2021
A SARS-CoV-2 sequence submission tool for the European Nucleotide Archive
Miguel Roncoroni
Bert Droesbeke
Ignacio Eguinoa
Kim De Ruyck
Flora D'Anna
Dilmurat Yusuf
Björn Grüning
Rolf Backofen
Frederik Coppens
A1
Artikel in een tijdschrift
in
BIOINFORMATICS
2021
A community roadmap for scientific workflows research and development
Rafael Ferreira da Silva
Henri Casanova
Kyle Chard
Ilkay Altintas
Rosa M. Badia
Bartosz Balis
Taina Coleman
Frederik Coppens
Frank Di Natale
Bjoern Enders
et al.
P1
Conferentie
2021
Ready-to-use public infrastructure for global SARS-CoV-2 monitoring
Wolfgang Maier
Simon Bray
Marius van den Beek
Dave Bouvier
Nathan Coraor
Milad Miladi
Babita Singh
Jordi Rambla De Argila
Dannon Baker
Nathan Roach
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NATURE BIOTECHNOLOGY
2021
The Arabidopsis condensin CAP‐D subunits arrange interphase chromatin
Celia Municio
Wojciech Antosz
Klaus D. Grasser
Etienne Kornobis
Michiel Van Bel
Ignacio Eguinoa
Frederik Coppens
Andrea Bräutigam
Inna Lermontova
Astrid Bruckmann
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NEW PHYTOLOGIST
2021
2020
Enabling reusability of plant phenomic datasets with MIAPPE 1.1
Evangelia A. Papoutsoglou
Daniel Faria
Daniel Arend
Elizabeth Arnaud
Ioannis N. Athanasiadis
Inês Chaves
Frederik Coppens
Guillaume Cornut
Bruno V. Costa
Hanna Cwiek-Kupczynska
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NEW PHYTOLOGIST
2020
No more business as usual : agile and effective responses to emerging pathogen threats require open data and open analytics
Dannon Baker
Marius van den Beek
Daniel Blankenberg
Dave Bouvier
John Chilton
Nate Coraor
Frederik Coppens
Ignacio Eguinoa
Simon Gladman
Björn Grüning
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLOS PATHOGENS
2020
Plant-RRBS : DNA methylome profiling adjusted to plant genomes, utilizing efficient endonuclease combinations, for multi-sample studies
Martin Schmidt
Magdalena Woloszynska
Michiel Van Bel
Frederik Coppens
Maria Van Lijsebettens
Hoofdstuk in een boek
in
Plant epigenetics and epigenomics : methods and protocols
2020
2019
Multifaceted activity of cytokinin in leaf development shapes its size and structure in Arabidopsis
Jan Skalák
Liesbeth Vercruyssen
Hannes Claeys
Jana Hradilová
Martin Černý
Ondřej Novák
Lenka Plačková
Iñigo Saiz-Fernández
Patricie Skaláková
Frederik Coppens
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT JOURNAL
2019
2018
PLAZA 4.0 : an integrative resource for functional, evolutionary and comparative plant genomics
Michiel Van Bel
Tim Diels
Emmelien Vancaester
Lukasz Kreft
Alexander Botzki
Yves Van de Peer
Frederik Coppens
Klaas Vandepoele
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NUCLEIC ACIDS RESEARCH
2018
The TriForC database : a comprehensive up-to-date resource of plant triterpene biosynthesis
Karel Miettinen
Sabrina Iñigo
Lukasz Kreft
Jacob Pollier
Christof De Bo
Alexander Botzki
Frederik Coppens
Soren Bak
Alain Goossens
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NUCLEIC ACIDS RESEARCH
2018
The reduction in maize leaf growth under mild drought affects the transition between cell division and cell expansion and cannot be restored by elevated gibberellic acid levels
Hilde Nelissen
Xiaohuan Sun
Bart Rymen
Yusuke Jikumaru
Mikko Kojima
Yumiko Takebayashi
Rafael Abbeloos
Kirin Demuynck
Veronique Storme
Marnik Vuylsteke
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT BIOTECHNOLOGY JOURNAL
2018
2017
Exploring plant co-expression and gene-gene Interactions with CORNET 3.0
Michiel Van Bel
Frederik Coppens
Hoofdstuk in een boek
in
Plant genomics databases : methods and protocols
2017
Natural variation of molecular and morphological gibberellin responses
Younjeong Nam
Dorota Herman
Jonas Blomme
Eunyoung Chae
Mikiko Kojima
Frederik Coppens
Veronique Storme
Twiggy Van Daele
Stijn Dhondt
Hitoshi Sakakibara
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT PHYSIOLOGY
2017
PhyD3 : a phylogenetic tree viewer with extended phyloXML support for functional genomics data visualization
Lukasz Kreft
Alexander Botzki
Frederik Coppens
Klaas Vandepoele
Michiel Van Bel
A1
Artikel in een tijdschrift
in
BIOINFORMATICS
2017
Plant-RRBS, a bisulfite and next-generation sequencing-based methylome profiling method enriching for coverage of cytosine positions
Martin Schmidt
Michiel Van Bel
Magdalena Woloszynska
Bram Slabbinck
Cindy Martens
Marc De Block
Frederik Coppens
Maria Van Lijsebettens
A1
Artikel in een tijdschrift
in
BMC PLANT BIOLOGY
2017
Proteome profiling of wheat shoots from different cultivars
Lam Dai Vu
Inge Verstraeten
Elisabeth Stes
Michiel Van Bel
Frederik Coppens
Kris Gevaert
Ive De Smet
A1
Artikel in een tijdschrift
in
FRONTIERS IN PLANT SCIENCE
2017
Unlocking the potential of plant phenotyping data through integration and data-driven approaches
Frederik Coppens
Nathalie Wuyts
Dirk Inzé
Stijn Dhondt
A2
Artikel in een tijdschrift
in
CURRENT OPINION IN SYSTEMS BIOLOGY
2017
2016
Combined large-scale phenotyping and transcriptomics in maize reveals a robust growth regulatory network
Joke Baute
Dorota Herman
Frederik Coppens
Jolien De Block
Bram Slabbinck
Matteo Dell'Acqua
Mario Enrico Pe
Steven Maere
Hilde Nelissen
Dirk Inzé
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT PHYSIOLOGY
2016
It's time for some 'site'-seeing: novel tools to monitor the ubiquitin landscape in Arabidopsis thaliana
Alan Walton
Elisabeth Stes
Nicolas Cybulski
Michiel Van Bel
Sabrina Iñigo
Astrid Nagels Durand
Evy Timmerman
Jefri Heyman
Laurens Pauwels
Lieven De Veylder
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT CELL
2016
Leaf growth response to mild drought : natural variation in Arabidopsis sheds light on trait architecture
Pieter Clauw
Frederik Coppens
Arthur Korte
Dorota Herman
Bram Slabbinck
Stijn Dhondt
Twiggy Van Daele
Liesbeth De Milde
Mattias Vermeersch
Katrien Maleux
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT CELL
2016
Tools and data services registry: a community effort to document bioinformatics resources
Jon Ison
Kristoffer Rapacki
Hervé Ménager
Matúš Kalaš
Emil Rydza
Piotr Chmura
Christian Anthon
Niall Beard
Karel Berka
Dan Bolser
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NUCLEIC ACIDS RESEARCH
2016
Up-to-date workflow for plant (phospho)proteomics identifies differential drought-responsive phosphorylation events in maize leaves
Lam Dai Vu
Elisabeth Stes
Michiel Van Bel
Hilde Nelissen
Davy Maddelein
Dirk Inzé
Frederik Coppens
Lennart Martens
Kris Gevaert
Ive De Smet
A1
Artikel in een tijdschrift
in
JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH
2016
2015
A conserved core of programmed cell death indicator genes discriminates developmentally and environmentally induced programmed cell death in plants
Yadira Olvera Carrillo
Michiel Van Bel
Tom Van Hautegem
Matyas Fendrych
Marlies Huysmans
Mária Braun Šimášková
Matthias Van Durme
Pierre Buscaill
Susana Rivas
Nuria S Coll
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT PHYSIOLOGY
2015
Correlation analysis of the transcriptome of growing leaves with mature leaf parameters in a maize RIL population
Joke Baute
Dorota Herman
Frederik Coppens
Jolien De Block
Bram Slabbinck
Matteo Dell'Acqua
Mario Enrico Pè
Steven Maere
Hilde Nelissen
Dirk Inzé
A1
Artikel in een tijdschrift
in
GENOME BIOLOGY
2015
Genetic properties of the MAGIC maize population: a new platform for high definition QTL mapping in Zea mays
Matteo Dell'Acqua
Daniel M Gatti
Giorgio Pea
Federica Cattonaro
Frederik Coppens
Gabriele Magris
Aye L Hlaing
Htay H Aung
Hilde Nelissen
Joke Baute
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
GENOME BIOLOGY
2015
Leaf responses to mild drought stress in natural variants of Arabidopsis
Pieter Clauw
Frederik Coppens
Kristof De Beuf
Stijn Dhondt
Twiggy Van Daele
Katrien Maleux
Veronique Storme
Lieven Clement
Nathalie Gonzalez Sanchez
Dirk Inzé
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT PHYSIOLOGY
2015
2014
ANGUSTIFOLIA3 binds to SWI/SNF chromatin remodeling complexes to regulate transcription during Arabidopsis leaf development
Liesbeth Vercruyssen
Aurine Verkest
Nathalie Gonzalez Sanchez
Ken Heyndrickx
Dominique Eeckhout
Soon-Ki Han
Teddy Jégu
Rafal Archacki
Jelle Van Leene
Megan Andriankaja
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT CELL
2014
Combining growth-promoting genes leads to positive epistasis in Arabidopsis thaliana
Hannes Vanhaeren
Nathalie Gonzalez Sanchez
Frederik Coppens
Liesbeth De Milde
Twiggy Van Daele
Mattias Vermeersch
Nubia Barbosa Eloy
Veronique Storme
Dirk Inzé
A1
Artikel in een tijdschrift
in
eLIFE
2014
High-resolution time-resolved imaging of in vitro Arabidopsis rosette growth
Stijn Dhondt
Nathalie Gonzalez Sanchez
Jonas Blomme
Liesbeth De Milde
Twiggy Van Daele
Dirk Van Akoleyen
Veronique Storme
Frederik Coppens
Gerrit Beemster
Dirk Inzé
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT JOURNAL
2014
2013
Brassinosteroid production and signaling differentially control cell division and expansion in the leaf
Miroslava Zhiponova
Isabelle Vanhoutte
Véronique Boudolf
Camilla Betti
Stijn Dhondt
Frederik Coppens
Evelien Mylle
Sara Maes
Mary-Paz González-García
Ana I Caño-Delgado
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NEW PHYTOLOGIST
2013
Kinematic analysis of cell division in leaves of mono- and dicotyledonous species: a basis for understanding growth and developing refined molecular sampling strategies
Hilde Nelissen
Bart Rymen
Frederik Coppens
Stijn Dhondt
Fabio Fiorani
Gerrit Beemster
Hoofdstuk in een boek
in
Plant organogenesis : methods and protocols
2013
2012
Exit from proliferation during leaf development in Arabidopsis thaliana: a not-so-gradual process
Megan Andriankaja
Stijn Dhondt
Stefanie De Bodt
Hannes Vanhaeren
Frederik Coppens
Liesbeth De Milde
Per Mühlenbock
Aleksandra Skirycz
Nathalie Gonzalez Sanchez
Gerrit Beemster
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
DEVELOPMENTAL CELL
2012
2011
Developmental regulation of CYCA2s contributes to tissue-specific proliferation in Arabidopsis
Steffen Vanneste
Frederik Coppens
EunKyoung Lee
Tyler J. Donner
Zidian Xie
Gert Van Isterdael
Stijn Dhondt
Freya De Winter
Bert De Rybel
Marnik Vuylsteke
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
EMBO JOURNAL
2011
Low magnesium status in plants enhances tolerance to cadmium exposure
Christian Hermans
Jiugeng Chen
Frederik Coppens
Dirk Inzé
Nathalie Verbruggen
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NEW PHYTOLOGIST
2011
Pause-and-stop: the effects of osmotic stress on cell proliferation during early leaf development in Arabidopsis and a role for ethylene signaling in cell cycle arrest
Aleksandra Skirycz
Hannes Claeys
Stefanie De Bodt
Akira Oikawa
Shoko Shinoda
Megan Andriankaja
Katrien Maleux
Nubia Barbosa Eloy
Frederik Coppens
Sang-Dong Yoo
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT CELL
2011
The plant-specific family of DNA-binding proteins containing three HMG-box domains interacts with mitotic and meiotic chromosomes
Dorthe S. Pedersen
Frederik Coppens
Lu Ma
Martin Antosch
Barbara Marktl
Thomas Merkle
Gerrit Beemster
Andreas Houben
Klaus D. Grasser
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NEW PHYTOLOGIST
2011
Transcriptional and post-transcriptional regulation of leaf development in Arabidopsis thaliana
Frederik Coppens
Dirk Inzé
Proefschrift
2011
2010
Early transcriptomic changes induced by magnesium deficiency in Arabidopsis thaliana reveal the alteration of circadian clock gene expression in roots and the triggering of abscisic acid-responsive genes
Christian Hermans
Marnik Vuylsteke
Frederik Coppens
Adrain Craciun
Dirk Inzé
Nathalie Verbruggen
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NEW PHYTOLOGIST
2010
Kinematic analysis of cell division and expansion
Bart Rymen
Frederik Coppens
Stijn Dhondt
Fabio Fiorani
Gerrit Beemster
Hoofdstuk in een boek
in
Plant developmental biology : methods and protocols
2010
SHORT-ROOT and SCARECROW regulate leaf growth in Arabidopsis by stimulating S-phase progression of the cell cycle
Stijn Dhondt
Frederik Coppens
Freya De Winter
Kamal Swarup
Roeland Merks
Dirk Inzé
Malcolm J Bennett
Gerrit Beemster
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLANT PHYSIOLOGY
2010
Systems analysis of the responses to long-term magnesium deficiency and restoration in Arabidopsis thaliana
Christian Hermans
Marnik Vuylsteke
Frederik Coppens
Simona M Cristescu
Frans JM Harren
Dirk Inzé
Nathalie Verbruggen
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NEW PHYTOLOGIST
2010
2009
Gibberellin signaling controls cell proliferation rate in Arabidopsis
Patrick Achard
Andi Gusti
Solzic Cheminant
Malek Alioua
Stijn Dhondt
Frederik Coppens
Gerrit Beemster
Pascal Genschik
A1
Artikel in een tijdschrift
in
Current Biology
2009
2006
The Arabidopsis anaphase promoting complex (APC): regulation through subunit availability in plant tissues
Nubia Barbosa Eloy
Frederik Coppens
Gerrit Beemster
Adriana Hemerly
Paulo Cavalcanti Gomes Ferreira
A1
Artikel in een tijdschrift
in
CELL CYCLE
2006