Instellingen beheren
MENU
Over deze site
In English
Home
Onderzoekers
Projecten
Organisaties
Publicaties
Infrastructuur
Contact
Research Explorer
Uw browser ondersteunt geen JavaScript of JavaScript is niet ingeschakeld. Zonder JavaScript kan sommige functionaliteit van deze webapplicatie uitgeschakeld zijn of foutmeldingen veroorzaken. Raadpleeg om JavaScript in te schakelen de handleiding van uw browser of contacteer uw systeembeheerder.
Onderzoeker
Filip Pattyn
Profiel
Projecten
Publicaties
Activiteiten
Prijzen & Erkenningen
59
Resultaten
2023
Cost-based analysis of the impact of data completeness and representational consistency
Yoram Timmerman
Rihem Nasfi
Guy De Tré
Filip Pattyn
Antoon Bronselaer
A1
Artikel in een tijdschrift
in
DECISION SUPPORT SYSTEMS
2023
2022
Dynamic repair of categorical data with edit rules
Antoon Bronselaer
Toon Boeckling
Filip Pattyn
A1
Artikel in een tijdschrift
in
EXPERT SYSTEMS WITH APPLICATIONS
2022
2020
Unravelling and resolving inefficient glucolipid biosurfactants production through quantitative multiomics analyses of Starmerella bombicola strains
Sofie Lodens
Sophie Roelants
Katarzyna Ciesielska
Robin Geys
Evelien Derynck
Karolien Maes
Filip Pattyn
Lisa Van Renterghem
Léopold Mottet
Sven Dierickx
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
BIOTECHNOLOGY AND BIOENGINEERING
2020
2019
Cost-effective and robust genotyping using double-mismatch allele-specific quantitative PCR
Steve Lefever
Ali Rihani
Joni Van der Meulen
Filip Pattyn
Tom Van Maerken
Jo Van Dorpe
Jan Hellemans
Jo Vandesompele
A1
Artikel in een tijdschrift
in
SCIENTIFIC REPORTS
2019
Unraveling and resolving inefficient glucolipid biosurfactants production through quantitative multiomics analyses of Starmerella bombicola strains
Sofie Lodens
Sophie Roelants
Katarzyna Ciesielska
Robin Geys
Evelien Derynck
Karolien Maes
Filip Pattyn
Lisa Van Renterghem
Léopold Mottet
Sven Dierickx
et al.
C3
Conferentie
2019
2017
Development and application of a molecular toolkit for the biosurfactant chassis organism Starmerella bombicola
Sofie Lodens
Sophie Roelants
Katarzyna Ciesielska
Robin Geys
Pieter Coussement
Filip Pattyn
Stijn Verweire
Lien Saey
Karen Saerens
Bart Devreese
et al.
C3
Conferentie
2017
High-throughput PCR assay design for targeted resequencing using primerXL
Steve Lefever
Filip Pattyn
Bram De Wilde
Frauke Coppieters
Sarah De Keulenaer
Jan Hellemans
Jo Vandesompele
A1
Artikel in een tijdschrift
in
BMC BIOINFORMATICS
2017
2016
Scaling out federated queries for life sciences data in production
Dieter De Witte
Laurens De Vocht
Filip Pattyn
Hans Constandt
Erik Mannens
Ruben Verborgh
C1
Conferentie
2016
2013
A dual approach for comprehensive genetic testing of ABCA4 in Stargardt disease
Miriam Bauwens
Caroline Van Cauwenbergh
Sarah De Jaegere
Steve Lefever
Barbara D'haene
Filip Pattyn
Thomy de Ravel de l'Argentière
Bart Leroy
Elfride De Baere
Frauke Coppieters
C3
Conferentie
2013
A dual approach for comprehensive genetic testing of ABCA4 in Stargardt disease
Miriam Bauwens
Caroline Van Cauwenbergh
Sarah De Jaegere
Steve Lefever
Barbara D'haene
Filip Pattyn
Bart Leroy
Elfride De Baere
Frauke Coppieters
C3
Conferentie
2013
Effective Alu repeat based RT-qPCR normalization in cancer cell perturbation experiments
Ali Rihani
Tom Van Maerken
Filip Pattyn
Gert Van Peer
Anneleen Beckers
Sara De Brouwer
Candy Kumps
Evelien Mets
Joni Van der Meulen
Pieter Rondou
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLOS ONE
2013
Focal DNA copy number changes in neuroblastoma target MYCN regulated genes
Candy Kumps
Annelies Fieuw
Pieter Mestdagh
Björn Menten
Steve Lefever
Filip Pattyn
Sara De Brouwer
Tom Sante
Johannes Hubertus Schulte
Alexander Schramm
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLOS ONE
2013
MYCN and HDAC2 cooperate to repress miR-183 signaling in neuroblastoma
Marco Lodrini
Ina Oehme
Christina Schroeder
Till Milde
Marie C Schier
Annette Kopp-Schneider
Johannes H Schulte
Matthias Fischer
Katleen De Preter
Filip Pattyn
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NUCLEIC ACIDS RESEARCH
2013
Single-nucleotide polymorphisms and other mismatches reduce performance of quantitative PCR assays
Steve Lefever
Filip Pattyn
Jan Hellemans
Jo Vandesompele
A1
Artikel in een tijdschrift
in
CLINICAL CHEMISTRY
2013
2012
Dickkopf-3 is regulated by the MYCN-induced miR-17-92 cluster in neuroblastoma
Sara De Brouwer
Pieter Mestdagh
Irina Lambertz
Filip Pattyn
Anne De Paepe
Frank Westermann
Christina Schroeder
Johannes H Schulte
Alexander Schramm
Katleen De Preter
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
INTERNATIONAL JOURNAL OF CANCER
2012
Identification of a novel recurrent 1q42.2-1qter deletion in high risk MYCN single copy 11q deleted neuroblastomas
Annelies Fieuw
Candy Kumps
Alexander Schramm
Filip Pattyn
Björn Menten
Francesca Antonacci
Peter Sudmant
Johannes H Schulte
Nadine Van Roy
Sarah Vergult
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
INTERNATIONAL JOURNAL OF CANCER
2012
MYCN directly regulates long non-coding RNA expression in neuroblastoma
Pieter Mestdagh
Johannes Schulte
Filip Pattyn
Frank Westermann
Genevieve Laureys
Franki Speleman
Jo Vandesompele
C3
Conferentie
2012
Massively parallel sequencing for early molecular diagnosis in Leber congenital amaurosis
Frauke Coppieters
Bram De Wilde
Steve Lefever
Ellen De Meester
Nina De Rocker
Caroline Van Cauwenbergh
Filip Pattyn
Françoise Meire
Bart Leroy
Jan Hellemans
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
GENETICS IN MEDICINE
2012
MiR-137 is epigenetically silenced in MYCN amplified neuroblastoma and targets the polycomb repressive complex 2 (PRC2) component EZH2
Anneleen Beckers
Maté Ongenaert
Anneleen Decock
Candy Kumps
Filip Pattyn
Pieter Mestdagh
Johannes H. Schulte
Franki Speleman
Katleen De Preter
C3
Conferentie
2012
MiR-137 is epigenetically silenced in MYCN amplified neuroblastomas and targets the polycomb repressive complex 2 (PRC2) component EZH2
Anneleen Beckers
Maté Ongenaert
Anneleen Decock
Candy Kumps
Filip Pattyn
the Neuroblastoma Research Consortium (NRC)
Pieter Mestdagh
Johannes H Schulte
Franki Speleman
Katleen De Preter
C3
Conferentie
2012
Molecular diagnostics for congenital hearing loss including 15 deafness genes using a next generation sequencing platform
Sarah De Keulenaer
Jan Hellemans
Steve Lefever
Jean-Pierre Renard
Joachim De Schrijver
Hendrik Van de Voorde
Mohammad Amin Tabatabaiefar
Filip Van Nieuwerburgh
Daisy Flamez
Filip Pattyn
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
BMC MEDICAL GENOMICS
2012
Targeted expression of mutated ALK induces neuroblastoma in transgenic mice
Lukas C Heukamp
Theresa Thor
Alexander Schramm
Katleen De Preter
Candy Kumps
Bram De Wilde
Andrea Odersky
Martin Peifer
Sven Lindner
Annika Spruessel
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
SCIENCE TRANSLATIONAL MEDICINE
2012
2011
Practical tools to implement massive parallel pyrosequencing of PCR products in next generation molecular diagnostics
Kim De Leeneer
Joachim De Schrijver
Lieven Clement
Machteld Baetens
Steve Lefever
Sarah De Keulenaer
Wim Van Criekinge
Dieter Deforce
Filip Van Nieuwerburgh
Sofie Bekaert
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLOS ONE
2011
The microRNA body map : dissecting microRNA function through integrative genomics
Pieter Mestdagh
Steve Lefever
Filip Pattyn
Dana Ridzon
Erik Fredlund
Annelies Fieuw
Maté Ongenaert
Joëlle Vermeulen
Anne De Paepe
Linda Wong
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NUCLEIC ACIDS RESEARCH
2011
2010
An integrative genomics screen uncovers ncRNA T-UCR functions in neuroblastoma tumours
Pieter Mestdagh
Erik Fredlund
Filip Pattyn
Ali Rihani
Tom Van Maerken
Joëlle Vermeulen
Candy Kumps
Björn Menten
Katleen De Preter
Alexander Schramm
et al.
C3
Conferentie
2010
An integrative genomics screen uncovers ncRNA T-UCR functions in neuroblastoma tumours
Pieter Mestdagh
E Fredlund
Filip Pattyn
Ali Rihani
Tom Van Maerken
Joëlle Vermeulen
Candy Kumps
Björn Menten
Katleen De Preter
A Schramm
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
ONCOGENE
2010
Analysing 454 amplicon resequencing experiments using the modular and database oriented Variant Identification Pipeline
Joachim De Schrijver
Kim De Leeneer
Steve Lefever
Nick Sabbe
Filip Pattyn
Filip Van Nieuwerburgh
Paul Coucke
Dieter Deforce
Jo Vandesompele
Sofie Bekaert
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
BMC BIOINFORMATICS
2010
MYCN/c-MYC-induced microRNAs repress coding gene networks associated with poor outcome in MYCN/c-MYC-activated tumors
Pieter Mestdagh
E Fredlund
Filip Pattyn
JH Schulte
D Muth
Joëlle Vermeulen
Candy Kumps
S Schlierf
Katleen De Preter
Nadine Van Roy
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
ONCOGENE
2010
The miRNA body map: dissecting miRNA function through integrative genomics
Pieter Mestdagh
Steve Lefever
Filip Pattyn
Dana Ridzon
Erik Fredlund
Annelies Fieuw
Joëlle Vermeulen
Anne De Paepe
Linda Wong
Franki Speleman
et al.
C3
Conferentie
2010
methGraph: A genome visualization tool for PCR-based methylation assays
Steve Lefever
Jasmien Hoebeeck
Filip Pattyn
Gábor Tusnády
Anne De Paepe
Franki Speleman
Tamás Arányi
Jo Vandesompele
A1
Artikel in een tijdschrift
in
EPIGENETICS
2010
2009
Aberrant methylation of candidate tumor suppressor genes in neuroblastoma
Jasmien Hoebeeck
Evi Michels
Filip Pattyn
Valerie Combaret
Joelle Vermeulen
Nurten Yigit
Claire Hoyoux
Genevieve Laureys
Anne De Paepe
Franki Speleman
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
CANCER LETTERS
2009
Disease-Causing 7.4 kb Cis-Regulatory Deletion Disrupting Conserved Non-Coding Sequences and Their Interaction with the FOXL2 Promotor: Implications for Mutation Screening
Barbara D'haene
C Attanasio
DIANE BEYSEN
J Dostie
E Lemire
P Bouchard
M Field
K Jones
B Lorenz
Björn Menten
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
PLOS GENETICS
2009
External oligonucleotide standards enable cross laboratory comparison and exchange of real-time quantitative PCR data
Joëlle Vermeulen
Filip Pattyn
Katleen De Preter
Liesbeth Vercruysse
Stefaan Derveaux
Pieter Mestdagh
Steve Lefever
Jan Hellemans
Franki Speleman
Jo Vandesompele
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NUCLEIC ACIDS RESEARCH
2009
Gebruik van genexpresieanalyse in de aanpak van neuroblastoom bij kinderen
Joëlle Vermeulen
Katleen De Preter
Pieter Mestdagh
Filip Pattyn
Anne De Paepe
Nadine Van Roy
Genevieve Laureys
Franki Speleman
Jo Vandesompele
A4
Artikel in een tijdschrift
in
ONCO (NEDERLANDSE ED.)
2009
Mapping of 5q35 chromosomal rearrangements within a genomically unstable region (vol 45, pg 672, 2008)
Karen Buysse
A Crepel
Björn Menten
Filip Pattyn
F Antonacci
JA Veltman
LA Larsen
Z Tumer
A de Klein
I van de Laar
et al.
Correctie
2009
Meta-mining of Neuroblastoma and Neuroblast Gene Expression Profiles Reveals Candidate Therapeutic Compounds
Katleen De Preter
Sara De Brouwer
Tom Van Maerken
Filip Pattyn
A Schramm
A Eggert
Jo Vandesompele
Franki Speleman
A1
Artikel in een tijdschrift
in
CLINICAL CANCER RESEARCH
2009
RDML : structured language and reporting guidelines for real-time quantitative PCR data
Steve Lefever
Jan Hellemans
Filip Pattyn
Daniel R Przybylski
Chris Taylor
René Geurts
Andreas Untergasser
Jo Vandesompele
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NUCLEIC ACIDS RESEARCH
2009
RNA pre-amplification enables large-scale RT-qPCR gene-expression studies on limiting sample amounts
Joëlle Vermeulen
Stefaan Derveaux
Steve Lefever
Els De Smet
Katleen De Preter
Nurten Yigit
Anne De Paepe
Filip Pattyn
Franki Speleman
Jo Vandesompele
A2
Artikel in een tijdschrift
in
BMC RESEARCH NOTES
2009
RTPrimerDB : the portal for real-time PCR primers and probes
Steve Lefever
Jo Vandesompele
Franki Speleman
Filip Pattyn
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NUCLEIC ACIDS RESEARCH
2009
The emerging molecular pathogenesis of neuroblastoma : implications for improved risk assessment and targeted therapy
Nadine Van Roy
Katleen De Preter
Jasmien Hoebeeck
Tom Van Maerken
Filip Pattyn
Pieter Mestdagh
Joëlle Vermeulen
Jo Vandesompele
Franki Speleman
A1
Artikel in een tijdschrift
in
GENOME MEDICINE
2009
Using real-time qPCR to evaluate RNAi-mediated gene silencing
Tom Van Maerken
Pieter Mestdagh
S De Clercq
Filip Pattyn
Nurten Yigit
Anne De Paepe
J C Marine
Franki Speleman
Jo Vandesompele
A2
Artikel in een tijdschrift
in
BioTechniques Protocol Guide
2009
2008
Distinct transcriptional MYCN/c-MYC activities are associated with spontaneous regression or malignant progression in neuroblastomas
F Westermann
D Muth
A Benner
T Bauer
KO Henrich
A Oberthuer
B Brors
T Beissbarth
Jo Vandesompele
Filip Pattyn
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
GENOME BIOLOGY
2008
Expression profiling of a new class of non-coding RNAs in human neuroblastoma
Pieter Mestdagh
Filip Pattyn
Katleen De Preter
Joëlle Vermeulen
Anne De Paepe
Franki Speleman
Jo Vandesompele
C3
Conferentie
2008
High throughput stem-loop RT-PCR miRNA expression profiling using minute amounts of input RNA reveals new insights in neuroblastoma pathogenesis
Pieter Mestdagh
Joëlle Vermeulen
Katleen De Preter
Filip Pattyn
Genevieve Laureys
Rosa Noguera
Marta Piqueras
Franki Speleman
Jo Vandesompele
C3
Conferentie
2008
MYCN regulates oncogenic and tumour suppressor miRNA networks in neuroblastoma
Pieter Mestdagh
Joëlle Vermeulen
Filip Pattyn
Liesbeth Vercruysse
Anne De Paepe
Genevieve Laureys
Franki Speleman
Jo Vandesompele
C3
Conferentie
2008
Mapping of 5q35 chromosomal rearrangements within a genomically unstable region
Karen Buysse
A CREPEL
Björn Menten
Filip Pattyn
F ANTONACCI
J VELTMAN
L LARSEN
Z TüMER
A DE KLEIN
I VAN DE LAAR
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
Journal of Medical Genetics
2008
Real-time qPCR as a tool for evaluating RNAi-mediated gene silencing
Tom Van Maerken
Pieter Mestdagh
Sarah De Clercq
Filip Pattyn
Nurten Yigit
Anne De Paepe
Jean-Christophe Marine
Franki Speleman
Jo Vandesompele
A2
Artikel in een tijdschrift
in
Bioradiations
2008
Unmasking of epigenetically silenced microRNAs in neuroblastoma
Jasmien Hoebeeck
Geert Declerck
Pieter Mestdagh
Filip Pattyn
Katleen De Preter
Joëlle Vermeulen
Nurten Yigit
Anne De Paepe
Franki Speleman
Jo Vandesompele
C3
Conferentie
2008
2007
Integrative genomics in neuroblastoma research
Franki Speleman
Katleen De Preter
Evi Michels
Jasmien Hoebeeck
Filip Pattyn
Joëlle Vermeulen
Nadine Van Roy
Anne De Paepe
Genevieve Laureys
Jo Vandesompele
C3
Conferentie
2007
Real-time PCR quality control for gene expression profiling on the LightCycler 480 System
Jasmien Hoebeeck
Filip Pattyn
Y NURTEN
E DE SMET
Franki Speleman
Jo Vandesompele
A3
Artikel in een tijdschrift
in
Biochemica
2007
2006
Identification of MYCN transcriptional target genes in neuroblastoma
Filip Pattyn
Franki Speleman
Jo Vandesompele
Proefschrift
2006
MethBLAST and methPrimerDB: web-tools for PCR based methylation analysis
Filip Pattyn
Jasmien Hoebeeck
Piet Robbrecht
Evi Michels
Anne De Paepe
G BOTTU
D COORNAERT
R HERZOG
Franki Speleman
Jo Vandesompele
A1
Artikel in een tijdschrift
in
BMC BIOINFORMATICS
2006
RTPrimerDB : the real-time PCR primer and probe database, major update 2006
Filip Pattyn
Piet Robbrecht
Anne De Paepe
Franki Speleman
Jo Vandesompele
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NUCLEIC ACIDS RESEARCH
2006
2005
arrayCGHbase: an analysis platform for comparative genomic hybridization microarrays
Björn Menten
Filip Pattyn
Katleen De Preter
Piet Robbrecht
Evi Michels
Karen Buysse
Geert Mortier
Anne De Paepe
Steven van Vooren
Joris Vermeesch
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
BMC BIOINFORMATICS
2005
2004
Combined subtractive cDNA cloning and array CGH: an efficient approach for identification of overexpressed genes in DNA amplicons
Katleen De Preter
Filip Pattyn
Geert Berx
Kristin Strumane
Björn Menten
Frans Van Roy
Anne De Paepe
Franki Speleman
Jo Vandesompele
A1
Artikel in een tijdschrift
in
BMC GENOMICS
2004
Neuroblastoma cells with overexpressed MYCN retain their capacity to undergo neuronal differentiation
A EDSJO
H NILSSON
Jo Vandesompele
J KARLSSON
Filip Pattyn
LA CULP
Franki Speleman
S PAHLMAN
A1
Artikel in een tijdschrift
in
LABORATORY INVESTIGATION
2004
2003
More than 125 FOXL2 mutations and variants in BPES and POF patients in the human FOXL2 allelic variant database
DIANE BEYSEN
Jo Vandesompele
Filip Pattyn
Anne De Paepe
Ludwine Messiaen
Elfride De Baere
C3
Conferentie
2003
RTPrimerDB : the Real-Time PCR primer and probe database
Filip Pattyn
Franki Speleman
Anne De Paepe
Jo Vandesompele
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NUCLEIC ACIDS RESEARCH
2003
2002
Accurate normalization of real-time quantitative RT-PCR data by geometric averaging of multiple internal control genes
Jo Vandesompele
Katleen De Preter
Filip Pattyn
Bruce Poppe
Nadine Van Roy
Anne De Paepe
Franki Speleman
A1
Artikel in een tijdschrift
in
GENOME BIOLOGY
2002