Instellingen beheren
MENU
Over deze site
In English
Home
Onderzoekers
Projecten
Organisaties
Publicaties
Infrastructuur
Contact
Research Explorer
Uw browser ondersteunt geen JavaScript of JavaScript is niet ingeschakeld. Zonder JavaScript kan sommige functionaliteit van deze webapplicatie uitgeschakeld zijn of foutmeldingen veroorzaken. Raadpleeg om JavaScript in te schakelen de handleiding van uw browser of contacteer uw systeembeheerder.
Onderzoeker
Andries De Koker
Profiel
Projecten
Publicaties
Activiteiten
Prijzen & Erkenningen
17
Resultaten
2024
A fast, affordable and minimally-invasive diagnostic test for Cancer of Unknown Primary (CUP) using DNA methylation profiling
Jilke De Wilde
Ruben Van Paemel
Andries De Koker
Sofie Roelandt
Sofie Van de Velde
Nico Callewaert
Jo Van Dorpe
David Creytens
Bram De Wilde
Katleen De Preter
A1
Artikel in een tijdschrift
in
LABORATORY INVESTIGATION
2024
Computational deconvolution of DNA methylation data from mixed DNA samples
Maísa Renata Ferro Dos Santos
Edoardo Giuili
Andries De Koker
Celine Everaert
Katleen De Preter
A1
Artikel in een tijdschrift
in
BRIEFINGS IN INFORMATICS
2024
2022
GENType : all-in-one preimplantation genetic testing by pedigree haplotyping and copy number profiling suitable for third-party reproduction
Lisa De Witte
Lennart Raman
Machteld Baetens
Andries De Koker
Nico Callewaert
Sofie Symoens
Kelly Tilleman
Frauke Vanden Meerschaut
Annelies Dheedene
Björn Menten
A1
Artikel in een tijdschrift
in
HUMAN REPRODUCTION
2022
The feasibility of using liquid biopsies as a complementary assay for copy number aberration profiling in routinely collected paediatric cancer patient samples
Ruben Van Paemel
Charlotte Vandeputte
Lennart Raman
Jolien Van Thorre
Leen Willems
Jo Van Dorpe
Malaïka Van der Linden
Jilke De Wilde
Andries De Koker
Björn Menten
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
EUROPEAN JOURNAL OF CANCER
2022
2021
Genome-wide study of the effect of blood collection tubes on the cell-free DNA methylome
Ruben Van Paemel
Andries De Koker
Christa Caggiano
Annelien Morlion
Pieter Mestdagh
Bram De Wilde
Jo Vandesompele
Katleen De Preter
A1
Artikel in een tijdschrift
in
EPIGENETICS
2021
Minimally invasive classification of pediatric solid tumors using reduced representation bisulfite sequencing of cell-free DNA : a proof-of-principle study
Ruben Van Paemel
Andries De Koker
Charlotte Vandeputte
Lieke van Zogchel
Tim Lammens
Genevieve Laureys
Jo Vandesompele
Gudrun Schleiermacher
Mathieu Chicard
Nadine Van Roy
et al.
A1
Artikel in een tijdschrift
in
EPIGENETICS
2021
2020
Minimally invasive classification of pediatric solid tumors using reduced representation bisulfite sequencing of cell-free DNA
Ruben Van Paemel
Andries De Koker
Charlotte Vandeputte
Lieke Van Zogchel
Tim Lammens
Genevieve Laureys
Jo Vandesompele
Gudrun Schleiermacher
Matthieu Chicard
Nadine Van Roy
et al.
C3
Conferentie
2020
2019
A fast, affordable and minimally-invasive diagnostic test for Cancer of Unknown Primary (CUP) using DNA methylation profiling
Jilke De Wilde
Ruben Van Paemel
Charlotte Vandeputte
Andries De Koker
Joni Van der Meulen
Malaïka Van der Linden
Nico Callewaert
Jo Van Dorpe
David Creytens
Bram De Wilde
et al.
C3
Conferentie
2019
A versatile method for circulating cell-free DNA methylome profiling by reduced representation bisulfite sequencing
Andries De Koker
Ruben Van Paemel
Bram De Wilde
Katleen De Preter
Nico Callewaert
Preprint
2019
Faster, cheaper and more accurate diagnosis of cancer of unknown primary (CUP) by using methylation profiling.
Jilke De Wilde
Ruben Van Paemel
Charlotte Vandeputte
Andries De Koker
Joni Van der Meulen
Malaïka Van der Linden
Nico Callewaert
Jo Van Dorpe
David Creytens
Bram De Wilde
et al.
C3
Conferentie
2019
Minimally invasive classification of pediatric solid tumors using reduced representation bisulfite sequencing of cell-free DNA : a proof-of-principle study
Ruben Van Paemel
Andries De Koker
Charlotte Vandeputte
Lieke van Zogchel
Tim Lammens
Genevieve Laureys
Jo Vandesompele
Gudrun Schleiermacher
Mathieu Chicard
Nadine Van Roy
et al.
Preprint
2019
Novel methods designed for diagnostic methylome profiling of blood circulating cell-free DNA : expanding the liquid biopsy molecular toolbox
Andries De Koker
Nico Callewaert
Proefschrift
2019
Shallow whole genome sequencing on circulating cell-free DNA in pediatric cancer patients
Charlotte Vandeputte
Jolien Van Thorre
Ruben Van Paemel
Andries De Koker
Leen Willems
Jo Van Dorpe
Malaïka Van der Linden
Jilke De Wilde
Björn Menten
L. van Zogchel
et al.
C3
Conferentie
2019
Shallow whole genome sequencing on circulating cell-free DNA in pediatric cancer patients
Charlotte Vandeputte
Jolien Van Thorre
Ruben Van Paemel
Andries De Koker
Leen Willems
Jo Van Dorpe
Malaïka Van der Linden
Jilke De Wilde
Björn Menten
Lieke van Zogchel
et al.
C3
Conferentie
2019
Shallow whole genome sequencing on circulating cell-free DNA in pediatric cancer patients
Charlotte Vandeputte
Jolien Van Thorre
Ruben Van Paemel
Andries De Koker
Leen Willems
Jo Van Dorpe
Malaïka Van der Linden
Jilke De Wilde
Björn Menten
Lieke van Zogchel
et al.
C3
Conferentie
2019
Successful copy number alteration profiling using circulating cell-free tumor DNA as a non-invasive alternative for tissue biopsies in pediatric cancer patients
Charlotte Vandeputte
Jolien Van Thorre
Ruben Van Paemel
Andries De Koker
Leen Willems
Jo Van Dorpe
Malaïka Van der Linden
Jilke De Wilde
Björn Menten
Lieke van Zogchel
et al.
C3
Conferentie
2019
2018
Capturing the ‘ome’ : the expanding molecular toolbox for RNA and DNA library construction
Morgane Boone
Andries De Koker
Nico Callewaert
A1
Artikel in een tijdschrift
in
NUCLEIC ACIDS RESEARCH
2018