Project

Isothermal STR Analysis Using Recombinase Polymerase Amplification with Probe-Based Genotyping for Microfluidic Chip Integration

Code
DOCT/012129
Duration
28 June 2024 → 21 September 2025 (Ongoing)
Doctoral researcher
Research disciplines
  • Medical and health sciences
    • Clinical forensic medicine
    • Clinical genetics and molecular diagnostics
Keywords
STR-genotyping Recombinase polymerase amplification Forensiscs
 
Project description

De huidige studie introduceert nieuwe methodologieën in de forensische and diagnostische wetenschap, met name de isotherme amplificatie van STR-loci via Recombinase Polymerase Amplificatie (RPA) en de ontwikkeling van RPA-compatibele, probe-gebaseerde genotypering. Centraal in dit onderzoek staat het isotherme mechanisme van RPA, dat de amplificatie van STR's bij een constante temperatuur mogelijk maakt, waardoor de noodzaak voor thermische cycli, vereist in traditionele Polymerase Chain Reaction (PCR) methoden, wordt geëlimineerd. Bovendien vervangt deze studie de conventionele vereiste voor alleeldetectie, doorgaans bereikt door elektroforese of massaal parallelle sequencing, door een lab-on-a-chip compatibele, probe-gebaseerde kwantitatieve RPA (qRPA) detectiemethode. Deze vooruitgang vermindert de behoefte aan uitgebreide apparatuur, wat de haalbaarheid van de implementatie van deze technologie in veldinzetbare, wegwerp microfluïdische lab-on-a-chip systemen verhoogt. Zo'n innovatie heeft aanzienlijk potentieel voor transformatieve toepassingen, vooral in situaties die snelle besluitvorming vereisen. De bruikbaarheid ervan strekt zich uit tot een scala aan gebieden, waaronder snelle diagnostiek, spoedeisende plaats delict onderzoeken, onmiddellijke identificatie van rampslachtoffers en kritische beoordelingen van voedselveiligheid.