Project

Ontrafelen van de regulatorische dynamiek van Kupffer-cel differentiatie

Acroniem
G033117N
Code
3G033117W
Looptijd
01-01-2017 → 31-12-2020
Financiering
Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek - Vlaanderen (FWO)
Onderzoeksdisciplines
  • Natural sciences
    • Other biological sciences
    • Other natural sciences
Trefwoorden
Kupffer
 
Projectomschrijving

  Macrofagen werden geïdentificeerd door de Nobelprijswinnaar Ilya Metchnikoff (1845 – 916). Genetische profilering van macrofagen uit verschillende weefsels heeft aangetoond verbazingwekkende diversiteit van deze cellen, hetgeen suggereert dat elke macrofaag diep is ingericht voor het weefsel van vestiging. Gebruik selfgenerated knock-in muizen die het specifieke depletie van lever macrofagen mogelijk, vonden we dat monocyten koloniseren de lever nis in één golf na depletie van macrofagen en snel differentiëren in lever macrofagen die transcriptioneel identiek zijn aan hun tegenhangers uitgeput. We willen nu aan de regelgevende dynamiek onderliggende lever macrofaagdifferentiatie ontrafelen. Er moeten factoren induceren van de expressie van de lever-specifieke gen handtekening. Dergelijke factoren worden genoemd transcriptiefactoren. Door het combineren van expertise in de ontwikkeling van computermodellen (Saeys groep) en zelf opgewekte experimentele muismodellen (Guilliams groeps) zullen we nieuwe data mining algoritmes die het mogelijk maken om te modelleren lever macrofaagdifferentiatie van highthroughput eencellige datasets te ontwerpen. Belangrijk is dat onze nieuwe muismodellen de in vivo validatie van deze in silico voorspellingen mogelijk te maken. We willen ontrafelen welke externe factoren de livermacrophage identiteit, waardoor transcriptiefactoren zij opereren en welke genen direct door deze transcriptiefactoren opdruk. Dit moet ten laatste ontrafelen de factoren die de ontwikkeling van deze cellen die meer dan een eeuw geleden werden geïdentificeerd rijden.