Mijn onderzoek omvat de verbetering en ontwikkeling van moleculaire dynamica simulatiestrategieën om computationele experimenten uit te voeren op biofysische processen. Dit maakt het mogelijk om met atomaire resolutie inzicht te krijgen in deze processen, zoals membraanpermeatie of binding van een medicijnmolecule aan een eiwit. De processen waar we ons op richten zijn die van (kanker)geneesmiddelmoleculen die een doelwit bereiken, zoals een eiwitbindingsplaats of het inwendige van een cel, waarbij we meestal de verblijftijd van het geneesmiddel of de permeatiesnelheidsconstante willen berekenen. 

Een belangrijke uitdaging van dit soort processen is het grote verschil in tijdschaal, waardoor onze computationele experimenten extreem veeleisend zijn. Mijn simulaties zijn daarom gebaseerd op de path sampling methodologie, die gebruik maakt van Metropolis Monte Carlo sampling in path space om zeldzame gebeurtenissen in deze complexe biologische systemen te ontdekken en te analyseren. Bovendien maakt path sampling het mogelijk om de exacte kinetiek te bestuderen van de processen die we simuleren. 

Het centrale doel van mijn onderzoek is het verder ontwikkelen van de path sampling methodologie om de kinetiek en werkzaamheid van bepaalde medicijnmoleculen te evalueren met behulp van moleculaire dynamica simulaties en op deze manier bij te dragen aan de ontdekking van (kanker)medicijnen.