Project

MOLECULAR DESIGN OF ‘FROZEN’ APTAMERS: Aptamers with enhanced properties by covalent and non-covalent stabilization using functionalized nucleotides: a combined modelling, NMR and electrochemistry approach

Code
3G054819
Duration
01 January 2019 → 31 December 2022
Funding
Research Foundation - Flanders (FWO)
Research disciplines
  • Natural sciences
    • Analytical chemistry not elsewhere classified
Keywords
Aptames
 
Project description

De on-site en zeer selectieve detectie van cocaïne en andere belangrijke doelanalyten zoals
antibioticaresiduen in afvalwater blijven een uitdagend onderzoeksgebied. In dit project willen we dat
beter begrijpen en uiteindelijk verbeteren van analytische detectiesystemen die kort DNA gebruiken
sequenties voor selectieve herkenning van interessante moleculen - aptamers genaamd - gevolgd door de
generatie van elektrische signalen na binding. Om dit te bereiken zullen we eerst het fundamentele bestuderen
invloed van structuur en flexibiliteit van aptameren op bindende en huidige generatie. Dit gaat verder
in kaart worden gebracht met behulp van computermodellering, NMR-spectroscopie en ITC-metingen. Na het verkrijgen
structurele kennis willen we de apters met hoge affiniteit chemisch stabiliseren door de introductie van
chemisch gemodificeerde bouwstenen in de aptamer-nucleïnezuursequentie. Het extra functioneel
groepen die aldus in de aptamer worden geïntroduceerd, zouden het mogelijk moeten maken om de stabiliteit van de gevouwen ligand te verbeteren
bindende staat van de aptamer. Op deze manier hopen we bij te dragen aan de ontwikkeling van meer robuust
apasensors. Dit moet uiteindelijk en op de lange termijn leiden tot verbeterd, robuust, eenvoudig en
mobiele apparaten die ter plaatse kunnen worden verwerkt in verschillende toepassingsgebieden (bijvoorbeeld wetshandhaving
agentschappen, medische zorgomgeving, voedselindustrie).