Single-cell SPACE

Een studie van de heterogeniciteit en dynamiek van normale en abnormale hematopoese met behulp van single-cell bioinformatica

Computationele cytometrie-technieken voor klinische toepassingen.

Het decoderen van de impact van intercellulaire communicatie op de identiteit van tumortoestanden bij epitheliale kankers

Aligneren van patient-specifieken cellontwikkelingstrajecten

Interpreteerbare modellen voor de integratieve analyse van single-cell spatiale transcriptoom data

Intercellulaire communicatie in tijd en ruimte

Klinische toepassingen van de computationele cytometrie

Betere inzichten in de spatiale organizatie van weefsels met behulp van machine learning en spatial transcriptomics

Een kwantitatieve vergelijking van deep learning technieken voor exploratieve en gesuperviseerde analyse van hoog-dimensionale cytometrie-data

Digitale innovatie voor mens en samenleving

Een benchmark-gebaseerde kwantificatie van de interpretabiliteit van neurale netwerk gebaseerde methoden

Een verkennend onderzoek van machine learning technieken voor afbeeldingsflowcytometrie.

Analyse van grote single-cell datasets met deep learning en parallelle multi-instance algoritmes

Een Formele Karakterisatie van de Robuustheid van Diepe Neurale Netwerken tegen Adversarial Perturbations

Verbeteren van de diagnose en prognose van primaire immuundeficiënties met behulp van computationele flowcytometrie

Een formele karakterisatie van de robuustheid van deep learning technieken

Modelleren van intercellulaire signalisatieprocessen tijdens cellulaire differentiatie op basis van transcriptoom data van individuele cellen.

Ontrafelen van de regulatorische dynamiek van Kupffer-cel differentiatie

Ontrafelen van de functionele diversiteit van macrofagen en dendritische cellen met behulp van modulenetwerken en intercellulaire signalisatienetwerken.

Methoden gebaseerd op vaag- en ruwverzamelingen voor het omgaan met ongebalanceerde en zwak gelabelde data in machineleren

Alliantieonderzoeksgroep: Logic Engineering

SpatialConnect: het connecteren van weefselbiologie met de spatiale genexpressie per individuele cel

Het ontrafelen van de rol van nucleaire receptor HNF4a in sepsis, alsook de mechanismen van zijn functieverlies in relatie tot het falen van PPARa.

‘Immunodeficiënties ten gevolge van IKAROS mutaties in het felle zonlicht’, een gedetailleerde studie die het genetische en immunologische spectrum van IKAROS-gemedieerde immuunstoornissen in kaart brengt.

De BD FACS Symphony FACS cell sorter : de meest geavanceerde multiparameter fluorescentie geactiveerde cell sorter die de indetificatie en purificatie van zeldzame cellen toelaat voor verdere functionele characterisatie

De ontwikkeling van een humaan pluripotent stamcel-gebaseerd differentiatiemodel om de normale en getransformeerde sympathoadrenale progenitors te bestuderen.

Ontrafelen van de choroid plexus heterogeniteit en de gevolgen ervan op de biologische respons op inflammatie reacties.

De ontwikkeling van T cel autoreactiviteit in reumatoïde artritis: de “smoking gun” hypothese

Multi-label semi-supervised leren voor big data problemen

Ontrafelen van het regulatorisch netwerk van dendritische celle met behulp van module netwerken.

Een verkennende studie van kenmerkselectietechnieken voor clustering

Onderzoek naar de immunologie van irreversibele luchtwegvernauwing bij astma

CONDITIONAL: COvid-19: iNteractie tussen genetische preDispositie en immunologisch fenotype

Covid-Track: toepassing van kwantitatieve virologie en single cell genomics om de interacties tussen virus en gastheer te ontrafelen die leiden tot ernstige immunologisch gemedieerde ziekte bij COVID-19-patiënten

De rol van mucosale integriteit in de pathogenese van spondyloartritis